More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1204 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  95.23 
 
 
441 aa  861    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  100 
 
 
442 aa  894    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  95.23 
 
 
441 aa  854    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  49.66 
 
 
493 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  49.11 
 
 
494 aa  455  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  51.92 
 
 
448 aa  455  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  50.23 
 
 
439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  48.05 
 
 
436 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  49.77 
 
 
455 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  48.62 
 
 
436 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  48.39 
 
 
436 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  48.39 
 
 
436 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  48.39 
 
 
436 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  48.39 
 
 
436 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  48.39 
 
 
436 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  48.39 
 
 
436 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  48.39 
 
 
436 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  49.21 
 
 
449 aa  430  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  47.48 
 
 
436 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  47.47 
 
 
436 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  46.56 
 
 
436 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  47 
 
 
436 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  46.35 
 
 
438 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  46.35 
 
 
438 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  46.45 
 
 
441 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  47.14 
 
 
441 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  46.56 
 
 
444 aa  421  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  48.07 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  45.35 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  48.75 
 
 
443 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  47.6 
 
 
439 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  44.85 
 
 
437 aa  414  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  45.64 
 
 
436 aa  411  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  47.95 
 
 
438 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  46.21 
 
 
440 aa  411  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.91 
 
 
438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  45.64 
 
 
436 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  48.17 
 
 
440 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  48.4 
 
 
440 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  46.35 
 
 
436 aa  403  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  45.64 
 
 
436 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  46.91 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  45.87 
 
 
449 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  46.58 
 
 
436 aa  397  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  46.21 
 
 
427 aa  396  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  45.62 
 
 
438 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  45.31 
 
 
446 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  43.94 
 
 
440 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  46.77 
 
 
441 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  44.02 
 
 
439 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  46.35 
 
 
439 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  43.79 
 
 
438 aa  378  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  44.91 
 
 
440 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  43.51 
 
 
441 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  43.02 
 
 
442 aa  374  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  43.96 
 
 
440 aa  372  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  44.37 
 
 
438 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2340  GTP-binding protein EngA  47.05 
 
 
453 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160254  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  44.01 
 
 
443 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  42.99 
 
 
448 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2143  GTP-binding protein EngA  43.45 
 
 
437 aa  363  3e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  43.12 
 
 
453 aa  363  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  43.15 
 
 
461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  42.76 
 
 
455 aa  360  4e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0387  GTP-binding protein EngA  42.5 
 
 
457 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04421  GTP-binding protein EngA  42.73 
 
 
457 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03881  GTP-binding protein EngA  44.42 
 
 
456 aa  359  6e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  42.5 
 
 
455 aa  359  6e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  41.8 
 
 
434 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  45.15 
 
 
452 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  42.95 
 
 
456 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  45.15 
 
 
452 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  42.66 
 
 
435 aa  355  5.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04111  GTP-binding protein EngA  42.27 
 
 
457 aa  355  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  42.43 
 
 
454 aa  355  7.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  42.76 
 
 
438 aa  354  1e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  43.37 
 
 
452 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  43.31 
 
 
456 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  41.57 
 
 
435 aa  354  2e-96  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  42.66 
 
 
438 aa  354  2e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  40.65 
 
 
435 aa  353  4e-96  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  41.41 
 
 
465 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  42.21 
 
 
447 aa  352  8.999999999999999e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  41.41 
 
 
465 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  40.87 
 
 
471 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  41.41 
 
 
465 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  40.87 
 
 
444 aa  350  3e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04531  GTP-binding protein EngA  41.63 
 
 
458 aa  349  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.491515  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  39.36 
 
 
439 aa  349  7e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  42.66 
 
 
453 aa  348  9e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5226  ribosome-associated GTPase EngA  41.57 
 
 
435 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.814163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0333  GTP-binding protein EngA  43.31 
 
 
453 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1497  small GTP-binding protein  41.23 
 
 
476 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642777  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  41.24 
 
 
445 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  41.24 
 
 
445 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  41.24 
 
 
445 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  41.24 
 
 
445 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1992  GTP-binding protein EngA  41.24 
 
 
446 aa  345  6e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.916192  normal  0.0223311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  41.01 
 
 
445 aa  346  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  41.01 
 
 
445 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.576586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>