More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1172 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  100 
 
 
438 aa  870    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  55.07 
 
 
438 aa  491  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  54.75 
 
 
443 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  54.75 
 
 
447 aa  478  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  52.39 
 
 
439 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  51.49 
 
 
441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  51.36 
 
 
441 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  50.57 
 
 
438 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  51.83 
 
 
439 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  51.26 
 
 
444 aa  448  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  47.94 
 
 
436 aa  437  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  50.34 
 
 
436 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  49.43 
 
 
436 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  47.73 
 
 
441 aa  433  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  48.74 
 
 
440 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  49.89 
 
 
441 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  46.54 
 
 
438 aa  427  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  47.71 
 
 
436 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  47.71 
 
 
436 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  46.22 
 
 
440 aa  425  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  47 
 
 
440 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  47.05 
 
 
440 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  46.22 
 
 
438 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  46.22 
 
 
438 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  47.14 
 
 
436 aa  425  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  46.58 
 
 
437 aa  420  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  47.14 
 
 
436 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  47.6 
 
 
436 aa  418  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  45.77 
 
 
436 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  46.59 
 
 
436 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  46.59 
 
 
436 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  46.59 
 
 
436 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  46.59 
 
 
436 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  46.59 
 
 
436 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  46.59 
 
 
436 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  46.59 
 
 
436 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  46.59 
 
 
436 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  48.98 
 
 
448 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  47.28 
 
 
427 aa  415  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  45.54 
 
 
436 aa  410  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  46 
 
 
436 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  46 
 
 
436 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  47.6 
 
 
438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  46.45 
 
 
441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  43.45 
 
 
439 aa  404  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  46.33 
 
 
439 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  45.25 
 
 
444 aa  404  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  47 
 
 
458 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04421  GTP-binding protein EngA  44.09 
 
 
457 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0387  GTP-binding protein EngA  43.41 
 
 
457 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04111  GTP-binding protein EngA  44.09 
 
 
457 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04531  GTP-binding protein EngA  43.99 
 
 
458 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.491515  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  46.68 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  46.83 
 
 
493 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  46.64 
 
 
449 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  45.62 
 
 
494 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  46.45 
 
 
440 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  46.14 
 
 
438 aa  395  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  43.41 
 
 
442 aa  398  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  45.98 
 
 
455 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  47.5 
 
 
449 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03881  GTP-binding protein EngA  44.67 
 
 
456 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  46.33 
 
 
453 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  47.71 
 
 
439 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  42.73 
 
 
452 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  44.44 
 
 
455 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  45.6 
 
 
434 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  45.8 
 
 
438 aa  387  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  44.52 
 
 
454 aa  385  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  42.89 
 
 
435 aa  384  1e-105  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  44.44 
 
 
456 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  44.06 
 
 
453 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  43.99 
 
 
455 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2340  GTP-binding protein EngA  45.93 
 
 
453 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160254  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  44.22 
 
 
461 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  45.59 
 
 
465 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  44.44 
 
 
456 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0333  GTP-binding protein EngA  42.27 
 
 
453 aa  383  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  46.33 
 
 
448 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  43.21 
 
 
441 aa  380  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  45.15 
 
 
465 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  44.39 
 
 
437 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  45.59 
 
 
465 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  43.61 
 
 
452 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  43.61 
 
 
452 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  43.79 
 
 
442 aa  378  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3073  GTP-binding protein EngA  43.22 
 
 
435 aa  376  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.348074  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  43.16 
 
 
434 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  44.29 
 
 
446 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2356  GTP-binding protein EngA  41.42 
 
 
437 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  40.37 
 
 
435 aa  372  1e-102  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  45.87 
 
 
443 aa  373  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1369  GTP-binding protein EngA  43.62 
 
 
434 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.911808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  44 
 
 
471 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  42.53 
 
 
441 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0400  GTP-binding protein EngA  41.97 
 
 
436 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.758155  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1651  GTP-binding protein EngA  42.95 
 
 
443 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  42.2 
 
 
435 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1813  GTP-binding protein EngA  42.2 
 
 
436 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.18548  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  41.53 
 
 
433 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>