More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1177 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  95.46 
 
 		 441 aa  864    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  95.23 
 
 		 442 aa  854    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  100 
 
 		 441 aa  895    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  51.92 
 
 		 448 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  49.33 
 
 		 493 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  48.88 
 
 		 494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  50.23 
 
 		 439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  47.93 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  48.16 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  47.93 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  47.93 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  47.93 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  47.93 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  47.93 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  47.36 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  47.93 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  49.1 
 
 		 455 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  47.24 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  46.79 
 
 		 436 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  48.54 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  46.77 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  47.37 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  46.22 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  45.87 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  48.75 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  48.05 
 
 		 438 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  45.64 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  47.27 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  45.66 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  45.66 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  47.83 
 
 		 439 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  45.18 
 
 		 436 aa  412  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.14 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  44.44 
 
 		 436 aa  412  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  47.95 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  43.81 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  45.52 
 
 		 440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  47.14 
 
 		 440 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  45.31 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  45.64 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  46.1 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  44.72 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  44.72 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  45.85 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  45.31 
 
 		 446 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  44.02 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  44.85 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  45.02 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  43.25 
 
 		 440 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  46 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  46.08 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  42.43 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  43.81 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  43.61 
 
 		 440 aa  375  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  43.95 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  44.01 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  42.99 
 
 		 448 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  42.53 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  43.64 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2340  GTP-binding protein EngA  46.68 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  43.09 
 
 		 443 aa  360  2e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  43.05 
 
 		 461 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04421  GTP-binding protein EngA  42.27 
 
 		 457 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  42.6 
 
 		 456 aa  359  6e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  42.95 
 
 		 456 aa  358  8e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0387  GTP-binding protein EngA  42.05 
 
 		 457 aa  358  8e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  41.57 
 
 		 434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  42.08 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  42.05 
 
 		 455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  43.6 
 
 		 452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  42.2 
 
 		 454 aa  356  3.9999999999999996e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2143  GTP-binding protein EngA  42.53 
 
 		 437 aa  356  5e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  44.32 
 
 		 452 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  44.32 
 
 		 452 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04111  GTP-binding protein EngA  41.82 
 
 		 457 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  41.8 
 
 		 435 aa  354  1e-96  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03881  GTP-binding protein EngA  43.74 
 
 		 456 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0333  GTP-binding protein EngA  43.54 
 
 		 453 aa  353  4e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  41.97 
 
 		 435 aa  352  8.999999999999999e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  41.99 
 
 		 447 aa  350  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  40.74 
 
 		 465 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04531  GTP-binding protein EngA  41.4 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.491515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  41.61 
 
 		 438 aa  349  6e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  40.74 
 
 		 465 aa  348  7e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  40.74 
 
 		 465 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  40.41 
 
 		 444 aa  348  8e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1497  small GTP-binding protein  40.55 
 
 		 476 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5226  ribosome-associated GTPase EngA  41.8 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.814163 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  40.18 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  40.53 
 
 		 471 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  39.59 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  42.21 
 
 		 453 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  41.51 
 
 		 438 aa  346  6e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1992  GTP-binding protein EngA  41.24 
 
 		 446 aa  345  7e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.916192  normal  0.0223311 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  44.12 
 
 		 441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  41.71 
 
 		 433 aa  342  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1428  GTP-binding protein EngA  40.18 
 
 		 447 aa  342  7e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0495777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0400  GTP-binding protein EngA  40.18 
 
 		 436 aa  342  8e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.758155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  41.84 
 
 		 458 aa  341  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2303  GTP-binding protein EngA  40.32 
 
 		 447 aa  341  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0637103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>