More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2008 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 438 aa  892    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 438 aa  892    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  60.14 
 
 		 440 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  60.82 
 
 		 441 aa  561  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  57.57 
 
 		 440 aa  525  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  57.86 
 
 		 441 aa  523  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  58.54 
 
 		 441 aa  522  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  55.45 
 
 		 439 aa  519  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  53.88 
 
 		 438 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  53.18 
 
 		 443 aa  508  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  55.48 
 
 		 436 aa  510  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  54 
 
 		 436 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  54.46 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  53.55 
 
 		 436 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  56.85 
 
 		 444 aa  507  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  55.15 
 
 		 438 aa  507  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  55.5 
 
 		 436 aa  504  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  53.9 
 
 		 436 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  52.52 
 
 		 436 aa  495  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  52.52 
 
 		 436 aa  496  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  52.75 
 
 		 441 aa  495  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  52.75 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  52.75 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  52.75 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  52.75 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  52.75 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  52.75 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  52.75 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  52.75 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  52.62 
 
 		 437 aa  488  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  53.44 
 
 		 436 aa  485  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  53.44 
 
 		 436 aa  485  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  52.62 
 
 		 436 aa  473  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  51.94 
 
 		 436 aa  471  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  51.48 
 
 		 436 aa  474  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  50.94 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  49.66 
 
 		 438 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  50.12 
 
 		 439 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  50.22 
 
 		 455 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  47.59 
 
 		 441 aa  448  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  47.93 
 
 		 440 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  48.16 
 
 		 440 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  50.34 
 
 		 493 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  50.23 
 
 		 448 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  47.49 
 
 		 439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  48.74 
 
 		 440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  48.76 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  49.88 
 
 		 439 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  49.09 
 
 		 449 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  49.32 
 
 		 494 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  51.48 
 
 		 440 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  48.31 
 
 		 442 aa  435  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  48.5 
 
 		 438 aa  435  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  48.54 
 
 		 448 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  46.22 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  46.35 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  45.66 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  45.66 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  47.86 
 
 		 447 aa  421  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  45.39 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  45.05 
 
 		 455 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3073  GTP-binding protein EngA  48.61 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.348074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  46.12 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  45.15 
 
 		 461 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  47.14 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  43.79 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03881  GTP-binding protein EngA  45.6 
 
 		 456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  44.02 
 
 		 456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  47.49 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  47.22 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  45.96 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  45.58 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2340  GTP-binding protein EngA  46.71 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  44.09 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  46.7 
 
 		 437 aa  398  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  42.92 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf303  GTP-binding protein EngA  47.27 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.778638  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  44.24 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  44.01 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1169  GTP-binding protein EngA  46.3 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.306254 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  44.9 
 
 		 454 aa  394  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  42.98 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  46.36 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5226  ribosome-associated GTPase EngA  44.44 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.814163 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  42.86 
 
 		 458 aa  388  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  42.76 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  45.14 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  43.54 
 
 		 471 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  42.76 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  44.98 
 
 		 438 aa  385  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  46.59 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  43.51 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44322  predicted protein  45.12 
 
 		 555 aa  382  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00480829  normal  0.0297324 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  43.51 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  43.64 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0400  GTP-binding protein EngA  43.19 
 
 		 436 aa  378  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.758155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04111  GTP-binding protein EngA  41.95 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  46.12 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04421  GTP-binding protein EngA  42.18 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04531  GTP-binding protein EngA  42.05 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.491515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>