More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2448 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  82.35 
 
 		 456 aa  772    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  81.26 
 
 		 455 aa  732    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 459 aa  924    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  89.32 
 
 		 459 aa  823    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  85.59 
 
 		 460 aa  806    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  96.3 
 
 		 460 aa  895    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  83.04 
 
 		 460 aa  768    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  65.58 
 
 		 458 aa  611  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  59.87 
 
 		 470 aa  567  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  58.85 
 
 		 467 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  57.63 
 
 		 473 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  56.87 
 
 		 490 aa  545  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  58.23 
 
 		 474 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  58.23 
 
 		 474 aa  544  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  55.65 
 
 		 492 aa  541  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  55.6 
 
 		 483 aa  538  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  55.49 
 
 		 483 aa  540  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  60.49 
 
 		 447 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  57.74 
 
 		 602 aa  538  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  57.89 
 
 		 473 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  57.32 
 
 		 470 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  61.88 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  54.98 
 
 		 483 aa  533  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  55.41 
 
 		 479 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  56.93 
 
 		 477 aa  531  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  60.04 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  60.04 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  59.6 
 
 		 448 aa  525  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  53.49 
 
 		 473 aa  518  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  55.22 
 
 		 489 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2160  GTP-binding protein EngA  55.91 
 
 		 487 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  60.04 
 
 		 446 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  55.14 
 
 		 487 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  55.14 
 
 		 487 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  55.53 
 
 		 456 aa  497  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  55.68 
 
 		 451 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  54.3 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  50.45 
 
 		 490 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  49.5 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0863  GTP-binding protein EngA  53.85 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145711  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  51.38 
 
 		 479 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  41.18 
 
 		 439 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.02 
 
 		 464 aa  350  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  41.45 
 
 		 495 aa  348  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.94 
 
 		 480 aa  346  4e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  38.55 
 
 		 442 aa  345  1e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  39.55 
 
 		 438 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  41.27 
 
 		 498 aa  343  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  41.77 
 
 		 473 aa  343  5e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  39.91 
 
 		 439 aa  342  5.999999999999999e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2102  GTP-binding protein EngA  42.01 
 
 		 447 aa  342  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0508209  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  40.22 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  40.86 
 
 		 498 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  40.95 
 
 		 444 aa  341  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  42.08 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  41.89 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  41.89 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  41.96 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  42.08 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.4 
 
 		 438 aa  339  5.9999999999999996e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2981  GTP-binding protein EngA  41.87 
 
 		 443 aa  339  7e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  40.45 
 
 		 440 aa  339  7e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  41.89 
 
 		 445 aa  339  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  41.89 
 
 		 445 aa  339  8e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  41.89 
 
 		 445 aa  339  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  41.76 
 
 		 446 aa  338  9e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  39.69 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  40.97 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  39.79 
 
 		 498 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2082  GTP-binding protein EngA  41.36 
 
 		 447 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  42.89 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  39.32 
 
 		 439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 		 445 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  41.4 
 
 		 490 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  41.5 
 
 		 464 aa  335  7e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2537  GTP-binding protein EngA  40.97 
 
 		 445 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358302  hitchhiker  0.0000595621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  40.54 
 
 		 440 aa  333  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2373  GTP-binding protein EngA  40.57 
 
 		 466 aa  333  3e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  40.97 
 
 		 567 aa  333  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  40.72 
 
 		 448 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1830  GTP-binding protein EngA  40.53 
 
 		 460 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  40.77 
 
 		 490 aa  333  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  40.77 
 
 		 490 aa  333  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2185  GTP-binding protein EngA  40.53 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  40.77 
 
 		 490 aa  333  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  40.77 
 
 		 490 aa  333  5e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1341  GTP-binding protein EngA  40.53 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  40.53 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  40.77 
 
 		 490 aa  333  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  40.53 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  40.53 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  40.77 
 
 		 490 aa  333  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  40.77 
 
 		 490 aa  333  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  40.77 
 
 		 490 aa  333  5e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  39.58 
 
 		 494 aa  333  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2223  GTP-binding protein EngA  40.53 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  36.94 
 
 		 439 aa  332  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  39.3 
 
 		 499 aa  332  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1233  GTP-binding protein EngA  40.82 
 
 		 488 aa  332  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>