More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3308 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  71.02 
 
 		 490 aa  724    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  71.02 
 
 		 490 aa  724    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2986  GTP-binding protein EngA  96.91 
 
 		 488 aa  939    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306969  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2733  GTP-binding protein EngA  70.65 
 
 		 494 aa  716    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  71.66 
 
 		 494 aa  742    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  71.02 
 
 		 490 aa  724    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  71.02 
 
 		 490 aa  724    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  66.87 
 
 		 498 aa  677    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  71.02 
 
 		 490 aa  724    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 487 aa  995    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3144  GTP-binding protein EngA  96.71 
 
 		 488 aa  938    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0749903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1309  GTP-binding protein EngA  89.37 
 
 		 490 aa  894    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00502538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3605  GTP-binding protein EngA  71.54 
 
 		 494 aa  714    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  71.03 
 
 		 497 aa  729    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1190  GTP-binding protein EngA  70.91 
 
 		 495 aa  722    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000499446  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  72.14 
 
 		 500 aa  760    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  71.02 
 
 		 490 aa  724    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1172  GTP-binding protein EngA  69.86 
 
 		 489 aa  706    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.120565  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0414  GTP-binding protein EngA  70.91 
 
 		 495 aa  722    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0317617  hitchhiker  0.000999032 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02977  GTP-binding protein EngA  68.72 
 
 		 481 aa  698    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  70.88 
 
 		 490 aa  731    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1294  GTP-binding protein EngA  89.78 
 
 		 489 aa  880    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  73.69 
 
 		 498 aa  764    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3010  GTP-binding protein EngA  71.83 
 
 		 495 aa  723    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  72.95 
 
 		 498 aa  764    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1262  GTP-binding protein EngA  70.12 
 
 		 495 aa  722    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1260  GTP-binding protein EngA  89.94 
 
 		 491 aa  902    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00475437  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1297  GTP-binding protein EngA  70.91 
 
 		 495 aa  722    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  71.02 
 
 		 490 aa  724    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3001  GTP-binding protein EngA  96.71 
 
 		 488 aa  938    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3122  GTP-binding protein EngA  68.92 
 
 		 482 aa  701    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2648  GTP-binding protein EngA  98.35 
 
 		 488 aa  982    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2361  GTP-binding protein EngA  87.89 
 
 		 488 aa  875    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.596104  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1377  GTP-binding protein EngA  96.71 
 
 		 488 aa  938    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.694687  normal  0.70956 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  66.47 
 
 		 511 aa  707    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  99.79 
 
 		 488 aa  993    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 488 aa  993    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1120  GTP-binding protein EngA  91.19 
 
 		 488 aa  886    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  71.11 
 
 		 490 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  71.02 
 
 		 490 aa  724    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1436  GTP-binding protein EngA  87.91 
 
 		 488 aa  873    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1548  GTP-binding protein EngA  86.68 
 
 		 488 aa  868    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  71.22 
 
 		 490 aa  726    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1233  GTP-binding protein EngA  99.79 
 
 		 488 aa  993    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4321  GTP-binding protein EngA  60.78 
 
 		 487 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000597657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0900  GTP-binding protein EngA  59.96 
 
 		 487 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0857  GTP-binding protein EngA  59.55 
 
 		 487 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40240  GTP-binding protein EngA  60.9 
 
 		 491 aa  597  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3496  GTP-binding protein EngA  60.21 
 
 		 492 aa  591  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0887  GTP-binding protein EngA  59.34 
 
 		 487 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4597  GTP-binding protein EngA  58.25 
 
 		 490 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1315  GTP-binding protein EngA  59.75 
 
 		 493 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14930  GTP-binding protein EngA  59.75 
 
 		 493 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1438  GTP-binding protein EngA  59.88 
 
 		 489 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1252  GTP-binding protein EngA  58.63 
 
 		 490 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  57.38 
 
 		 464 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1438  GTP-binding protein EngA  56.67 
 
 		 471 aa  564  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1131  GTP-binding protein EngA  55.94 
 
 		 473 aa  558  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2858  small GTP-binding protein protein  55.44 
 
 		 467 aa  557  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  54.32 
 
 		 462 aa  549  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  54.73 
 
 		 462 aa  548  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  55.72 
 
 		 445 aa  548  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0738  ribosome-associated GTPase EngA  54.75 
 
 		 484 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.922813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  55.49 
 
 		 467 aa  541  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0011  GTP-binding protein EngA  52.41 
 
 		 472 aa  536  1e-151  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.162557  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  53.59 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0686  GTP-binding protein EngA  52.94 
 
 		 473 aa  519  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0656  GTP-binding protein EngA  53.51 
 
 		 480 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  51.41 
 
 		 473 aa  512  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  52.36 
 
 		 463 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  50.63 
 
 		 480 aa  499  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  50.41 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0591  GTP-binding protein EngA  52.77 
 
 		 472 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  51.75 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0598  GTP-binding protein EngA  50.21 
 
 		 469 aa  465  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2537  GTP-binding protein EngA  49.78 
 
 		 445 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358302  hitchhiker  0.0000595621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1416  GTP-binding protein EngA  49.68 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592606 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1329  GTP-binding protein EngA  48.39 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1341  GTP-binding protein EngA  49.14 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2223  GTP-binding protein EngA  49.14 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  49.14 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2185  GTP-binding protein EngA  49.14 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880216  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  49.14 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  49.14 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  49.57 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  49.35 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  49.35 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1390  GTP-binding protein EngA  48.39 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  49.14 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1830  GTP-binding protein EngA  49.14 
 
 		 460 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  49.35 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  48.92 
 
 		 445 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2373  GTP-binding protein EngA  49.68 
 
 		 466 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  48.92 
 
 		 445 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  48.92 
 
 		 445 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  49.14 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  50 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  50 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2082  GTP-binding protein EngA  47.84 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543675  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2102  GTP-binding protein EngA  48.16 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0508209  normal  0.0433282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>