86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56002 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  100 
 
 		 162 aa  331  3e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  56.79 
 
 		 182 aa  201  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  57.67 
 
 		 185 aa  200  9e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  56.25 
 
 		 181 aa  191  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  55.35 
 
 		 183 aa  188  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  53.7 
 
 		 182 aa  187  5e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  53.7 
 
 		 180 aa  185  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  53.7 
 
 		 181 aa  185  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  53.75 
 
 		 184 aa  183  8e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  52.83 
 
 		 211 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  51.59 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  50.96 
 
 		 175 aa  172  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  47.77 
 
 		 182 aa  164  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  48.41 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  45.28 
 
 		 184 aa  151  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  42.77 
 
 		 187 aa  138  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  40.25 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  37.58 
 
 		 184 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  37.04 
 
 		 177 aa  123  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  33.13 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348621 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  34.16 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  33.13 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  35.44 
 
 		 195 aa  104  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  38.92 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  37.59 
 
 		 189 aa  99.4  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  42.98 
 
 		 192 aa  98.6  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  37.04 
 
 		 190 aa  95.9  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  34.81 
 
 		 182 aa  95.1  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  37.59 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  33.53 
 
 		 193 aa  92  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  32.05 
 
 		 174 aa  85.9  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  28.99 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  43.82 
 
 		 276 aa  80.5  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  29.27 
 
 		 200 aa  70.9  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  32.33 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  25.16 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  25.58 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  27.27 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  28.81 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  28.93 
 
 		 252 aa  51.6  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  28.06 
 
 		 207 aa  51.2  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  26.67 
 
 		 208 aa  51.2  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  28.81 
 
 		 203 aa  51.2  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  25.95 
 
 		 215 aa  51.2  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  27.12 
 
 		 203 aa  51.2  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  23.23 
 
 		 210 aa  50.8  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  28.31 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  23.35 
 
 		 205 aa  48.5  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  28.09 
 
 		 207 aa  48.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  25 
 
 		 201 aa  47.8  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  25.64 
 
 		 208 aa  47.4  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  25.29 
 
 		 183 aa  47.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  24.43 
 
 		 207 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  30.86 
 
 		 240 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  25.15 
 
 		 237 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  30.53 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  24.59 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  29.35 
 
 		 307 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0253  protein of unknown function, ATP binding  24.65 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  24.19 
 
 		 205 aa  45.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  32.54 
 
 		 214 aa  45.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  25.19 
 
 		 202 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  26.57 
 
 		 201 aa  44.3  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  26.32 
 
 		 885 aa  44.3  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36721  predicted protein  32.58 
 
 		 323 aa  43.9  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  28.09 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  25.2 
 
 		 233 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.14 
 
 		 1107 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  26.45 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3230  small GTP-binding protein  24.22 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.137976 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  23.97 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  25.6 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  25.64 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.26784 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  26.14 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  26.6 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  28.05 
 
 		 213 aa  42  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1476  Miro domain protein  32.22 
 
 		 998 aa  42  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184541  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  24.79 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  28.92 
 
 		 748 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  34.88 
 
 		 186 aa  41.2  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  26.96 
 
 		 937 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  26.96 
 
 		 937 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  22.64 
 
 		 165 aa  40.8  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  25.9 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  27.27 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  25.4 
 
 		 196 aa  40.4  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>