56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43732 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  100 
 
 
193 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  68.23 
 
 
189 aa  266  2e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  61.98 
 
 
192 aa  261  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  67.19 
 
 
189 aa  259  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  65.62 
 
 
190 aa  257  8e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  38.67 
 
 
174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  33.51 
 
 
186 aa  108  7.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  33.92 
 
 
175 aa  105  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  31.46 
 
 
183 aa  101  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  32.57 
 
 
182 aa  99  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  34.09 
 
 
184 aa  99  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  31.18 
 
 
185 aa  98.2  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  31.79 
 
 
184 aa  98.2  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  30.99 
 
 
181 aa  96.3  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  30.81 
 
 
180 aa  95.5  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  35.22 
 
 
177 aa  95.5  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  35.88 
 
 
182 aa  95.1  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  35.11 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  30.81 
 
 
184 aa  92.4  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  34.35 
 
 
182 aa  92  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  33.53 
 
 
162 aa  92  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  27.59 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  32.03 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  33.58 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  30.99 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  29.82 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  32.45 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  32.45 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  29.08 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  27.78 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  32.14 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  36.67 
 
 
276 aa  62.4  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  25.27 
 
 
195 aa  61.2  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  32.35 
 
 
223 aa  57.4  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  23.4 
 
 
200 aa  54.7  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  26.83 
 
 
291 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  29.73 
 
 
289 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  26.09 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  27.7 
 
 
281 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  28.77 
 
 
289 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  34.19 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  25.85 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  31.54 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  30 
 
 
473 aa  42.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35327  predicted protein  29.21 
 
 
431 aa  42.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  25 
 
 
739 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  25.85 
 
 
176 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  24.14 
 
 
692 aa  42  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  31.74 
 
 
195 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1219  small GTP-binding protein  27.17 
 
 
212 aa  41.6  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  30.87 
 
 
195 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  30.87 
 
 
195 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  30.87 
 
 
195 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  25 
 
 
206 aa  41.2  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  30.95 
 
 
195 aa  41.2  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  26.44 
 
 
460 aa  41.2  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>