93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06630 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  100 
 
 
182 aa  377  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  74.86 
 
 
185 aa  289  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  69.83 
 
 
181 aa  277  7e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  69.66 
 
 
182 aa  275  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  69.27 
 
 
180 aa  272  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  68.36 
 
 
181 aa  270  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  67.42 
 
 
183 aa  265  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  68.16 
 
 
184 aa  258  4e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  55.98 
 
 
211 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  55.81 
 
 
175 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  56.04 
 
 
185 aa  207  4e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.121793 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  53.07 
 
 
182 aa  202  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  56.79 
 
 
162 aa  201  6e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  55.15 
 
 
186 aa  200  8e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  50 
 
 
184 aa  197  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  43.58 
 
 
182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  42.51 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  39.63 
 
 
184 aa  140  7e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  33.52 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  38.27 
 
 
195 aa  114  7.999999999999999e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  35.67 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  34.3 
 
 
189 aa  107  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  33.72 
 
 
189 aa  107  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  33.53 
 
 
190 aa  105  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  32.73 
 
 
179 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  33.94 
 
 
182 aa  99  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  32.75 
 
 
186 aa  99  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  34.32 
 
 
185 aa  98.6  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  32.75 
 
 
186 aa  99  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  34.35 
 
 
193 aa  92  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  30.99 
 
 
242 aa  80.9  0.000000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  41.3 
 
 
276 aa  78.2  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  30.18 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  26.26 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  31.06 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  32.97 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  28.33 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  29.35 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  27.48 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  25.35 
 
 
233 aa  51.6  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  28.57 
 
 
207 aa  51.2  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  29.17 
 
 
885 aa  51.2  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  29.46 
 
 
196 aa  51.2  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  33.85 
 
 
289 aa  50.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  28.57 
 
 
203 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  29.11 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  25.62 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  26.05 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  25.83 
 
 
208 aa  49.3  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  29.06 
 
 
240 aa  49.3  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0379  small GTP-binding protein  28.17 
 
 
191 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.81 
 
 
1107 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  30.08 
 
 
191 aa  48.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  30.83 
 
 
214 aa  48.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  27.97 
 
 
195 aa  47.8  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  26.88 
 
 
291 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.51 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  24.58 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  30.53 
 
 
307 aa  47.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  27.97 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  25.84 
 
 
213 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  25.84 
 
 
208 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  25.51 
 
 
211 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  30.51 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3230  small GTP-binding protein  26.57 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.137976 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  24.29 
 
 
230 aa  45.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  28.81 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  28.81 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  28.57 
 
 
195 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  23.73 
 
 
214 aa  45.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  25.18 
 
 
258 aa  45.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  28.93 
 
 
201 aa  45.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  25 
 
 
206 aa  44.7  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  25.41 
 
 
252 aa  44.7  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  26.53 
 
 
387 aa  44.7  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  24.85 
 
 
183 aa  44.7  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  25.42 
 
 
215 aa  43.9  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  22.22 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  30.61 
 
 
937 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  30.61 
 
 
937 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  30.33 
 
 
196 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  27.34 
 
 
195 aa  42.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  23.33 
 
 
200 aa  42.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.26784 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  22.44 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  24.59 
 
 
218 aa  42.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  26.05 
 
 
210 aa  42.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  26.19 
 
 
205 aa  42.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  26.89 
 
 
195 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  26.97 
 
 
748 aa  41.6  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  24.83 
 
 
220 aa  41.2  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  25 
 
 
212 aa  41.2  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  23.77 
 
 
289 aa  40.8  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0253  protein of unknown function, ATP binding  22.63 
 
 
182 aa  40.8  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>