53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI03960 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  50.28 
 
 
182 aa  180  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  48.86 
 
 
175 aa  178  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  46.93 
 
 
180 aa  177  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  44.69 
 
 
181 aa  175  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  45.81 
 
 
181 aa  174  4e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  44.38 
 
 
184 aa  171  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  46.67 
 
 
184 aa  169  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  43.41 
 
 
182 aa  167  6e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  43.75 
 
 
183 aa  166  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  46.29 
 
 
185 aa  166  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  43.58 
 
 
182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  42.22 
 
 
185 aa  155  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  42.7 
 
 
186 aa  154  6e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  40.78 
 
 
211 aa  145  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  40.85 
 
 
184 aa  137  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  40.25 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  42.26 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  35.23 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  35.67 
 
 
195 aa  99.8  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  33.14 
 
 
179 aa  92  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  29.51 
 
 
192 aa  91.3  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  27.59 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  28.95 
 
 
242 aa  87.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  33.33 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  29.82 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  31.18 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  30.17 
 
 
189 aa  82  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  29.48 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  29.48 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  29.49 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  35.64 
 
 
276 aa  63.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  30.4 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  32.59 
 
 
223 aa  57  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  25.56 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1438  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.22 
 
 
437 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000421865  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  32.77 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  25.61 
 
 
203 aa  49.3  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  31.36 
 
 
208 aa  45.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  30.94 
 
 
205 aa  45.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  31.93 
 
 
201 aa  45.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  31.15 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  26.7 
 
 
424 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_23444  predicted protein  25.44 
 
 
676 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.28731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  28.34 
 
 
423 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  27.34 
 
 
205 aa  42.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  24.24 
 
 
214 aa  42  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  30.17 
 
 
208 aa  41.6  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.95 
 
 
438 aa  41.6  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  22.73 
 
 
289 aa  41.6  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3129  GTP-binding protein  22.64 
 
 
213 aa  41.6  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144339  normal  0.904032 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  30.89 
 
 
885 aa  41.6  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  25.29 
 
 
183 aa  40.8  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>