More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3129 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3129  GTP-binding protein  100 
 
 		 213 aa  441  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144339  normal  0.904032 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1892  small GTP-binding protein  73.04 
 
 		 207 aa  323  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1219  small GTP-binding protein  65.73 
 
 		 212 aa  293  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2232  GTP-binding protein, HSR1-related  55.77 
 
 		 217 aa  244  9e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1793  GTP-binding protein, HSR1-related  53.49 
 
 		 213 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0804701  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2664  small GTP-binding protein  52.8 
 
 		 212 aa  241  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000173682  normal  0.819778 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0751  hypothetical protein  55.29 
 
 		 208 aa  240  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.489882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3778  small GTP-binding protein  51.63 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1929  small GTP-binding protein  51.16 
 
 		 212 aa  231  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2746  GTP-binding protein HSR1-related  51.63 
 
 		 213 aa  231  9e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0814  GTP-binding protein HSR1-related  51.16 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.826996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2908  small GTP-binding protein domain-containing protein  50.73 
 
 		 209 aa  227  9e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.633867 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1615  small GTP-binding protein  49.3 
 
 		 213 aa  223  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  26.53 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  29.9 
 
 		 462 aa  62  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  26.47 
 
 		 856 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  27.23 
 
 		 831 aa  56.2  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 489 aa  55.1  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  29.41 
 
 		 622 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  27.23 
 
 		 438 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  28.8 
 
 		 440 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  28.76 
 
 		 641 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15530  small GTP-binding protein domain protein  27.74 
 
 		 636 aa  53.9  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  25.52 
 
 		 299 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  30.27 
 
 		 438 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1619  GTP-binding protein LepA  26.87 
 
 		 604 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  26.29 
 
 		 985 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  26.57 
 
 		 881 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  26.02 
 
 		 446 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  25.13 
 
 		 450 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  23 
 
 		 874 aa  52.8  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  27.92 
 
 		 492 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  26.9 
 
 		 301 aa  52.4  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  26.37 
 
 		 447 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  28.12 
 
 		 306 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  27.5 
 
 		 470 aa  52  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1131  GTP-binding protein EngA  28.43 
 
 		 473 aa  51.6  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  24.23 
 
 		 298 aa  51.6  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  24.74 
 
 		 297 aa  51.6  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1332  GTP-binding protein LepA  26.37 
 
 		 601 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214925  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1466  GTP-binding protein LepA  28.5 
 
 		 601 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  24.38 
 
 		 686 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  23.59 
 
 		 888 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  28.27 
 
 		 296 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  26.04 
 
 		 885 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  26.37 
 
 		 845 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  24.38 
 
 		 686 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  25.5 
 
 		 446 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1438  GTP-binding protein EngA  26.47 
 
 		 471 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  24.39 
 
 		 460 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  25.25 
 
 		 888 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0722  GTP-binding protein TypA  29.49 
 
 		 611 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  24.38 
 
 		 688 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  24.38 
 
 		 686 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  24.38 
 
 		 686 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  24.38 
 
 		 686 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0948  GTP-binding protein LepA  27.84 
 
 		 605 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  27.59 
 
 		 490 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  27.27 
 
 		 456 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  25.25 
 
 		 448 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  24.02 
 
 		 459 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  24.38 
 
 		 686 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  24.88 
 
 		 460 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  24.38 
 
 		 686 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  25.6 
 
 		 884 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  25.37 
 
 		 895 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2535  GTP-binding protein TypA  33 
 
 		 642 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000592047 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  24.77 
 
 		 848 aa  50.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3469  GTP-binding protein LepA  25.26 
 
 		 611 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  25.62 
 
 		 912 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  25.76 
 
 		 836 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3825  translation initiation factor IF-2  24.38 
 
 		 430 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.29796e-61 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  24.51 
 
 		 904 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  24.38 
 
 		 689 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5462  translation initiation factor IF-2  25.37 
 
 		 837 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  25.76 
 
 		 836 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  25.76 
 
 		 838 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0767  GTP-binding protein LepA  25.26 
 
 		 596 aa  49.7  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  26 
 
 		 299 aa  49.7  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  26.63 
 
 		 460 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  24.51 
 
 		 853 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2195  GTP-binding protein LepA  25.89 
 
 		 596 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0205071  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0118  GTP-binding protein LepA  24.74 
 
 		 625 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62760  translation initiation factor IF-2  25.37 
 
 		 840 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0503522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  27.18 
 
 		 498 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  32.14 
 
 		 606 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  27.96 
 
 		 438 aa  49.7  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2101  GTP-binding protein TypA  32.14 
 
 		 606 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3113  GTP-binding protein TypA  27.63 
 
 		 620 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218846  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  26.83 
 
 		 445 aa  49.3  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  25.76 
 
 		 896 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  26.15 
 
 		 896 aa  49.3  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  27.09 
 
 		 438 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  23.81 
 
 		 943 aa  49.3  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1688  GTP-binding protein LepA  27.89 
 
 		 602 aa  48.9  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  29.38 
 
 		 416 aa  49.3  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  27.36 
 
 		 968 aa  49.3  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  25.7 
 
 		 297 aa  48.9  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  23.88 
 
 		 688 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0855  GTP-binding protein LepA  26.32 
 
 		 596 aa  49.3  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0509078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>