More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4334 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  100 
 
 
424 aa  850    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.86 
 
 
425 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  61.81 
 
 
428 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  60.14 
 
 
432 aa  478  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  60.33 
 
 
422 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  58.22 
 
 
428 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  57.75 
 
 
428 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  57.51 
 
 
428 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  57.75 
 
 
428 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  57.75 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  57.75 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  57.75 
 
 
428 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  57.75 
 
 
428 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  57.75 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  57.98 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  57.41 
 
 
427 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  61.79 
 
 
423 aa  453  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  60.23 
 
 
419 aa  451  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.87 
 
 
426 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.68 
 
 
417 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  54.85 
 
 
424 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.43 
 
 
425 aa  433  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  53.72 
 
 
430 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  53.72 
 
 
430 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  52.79 
 
 
430 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  53.38 
 
 
427 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  54.48 
 
 
437 aa  415  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  59.72 
 
 
425 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  54.02 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.65 
 
 
426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.55 
 
 
452 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  49.89 
 
 
439 aa  393  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  48.36 
 
 
423 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.8 
 
 
464 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  50.23 
 
 
428 aa  379  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.54 
 
 
438 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  51.73 
 
 
437 aa  376  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.17 
 
 
482 aa  374  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  50.23 
 
 
435 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  49.65 
 
 
435 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.89 
 
 
463 aa  375  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.9 
 
 
429 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  49.31 
 
 
434 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  60.56 
 
 
346 aa  369  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  48.72 
 
 
428 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  48.72 
 
 
428 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.23 
 
 
464 aa  367  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  52 
 
 
439 aa  363  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.58 
 
 
437 aa  360  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  57.01 
 
 
338 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  58.54 
 
 
338 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  46.9 
 
 
436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.17 
 
 
454 aa  353  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  56.4 
 
 
338 aa  352  7e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.47 
 
 
434 aa  344  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  56.5 
 
 
353 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.29 
 
 
426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  53.92 
 
 
338 aa  343  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.73 
 
 
458 aa  341  1e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.12 
 
 
435 aa  342  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  53.96 
 
 
338 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  46.8 
 
 
439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.23 
 
 
439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  58.01 
 
 
354 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  56.44 
 
 
397 aa  339  5e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  58.01 
 
 
354 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  56.62 
 
 
387 aa  339  5.9999999999999996e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  58.01 
 
 
354 aa  338  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  56.48 
 
 
353 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  55.45 
 
 
338 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  54.22 
 
 
395 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  55.26 
 
 
372 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  54.83 
 
 
338 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  45.41 
 
 
440 aa  330  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  54.05 
 
 
347 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  55.26 
 
 
372 aa  329  6e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  55.26 
 
 
372 aa  329  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  55.26 
 
 
372 aa  329  6e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  55.26 
 
 
372 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  55.26 
 
 
372 aa  329  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  55.26 
 
 
372 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  54.95 
 
 
372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  56.25 
 
 
356 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  54.63 
 
 
392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.96 
 
 
428 aa  326  5e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  53.82 
 
 
365 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.05 
 
 
356 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  54.43 
 
 
365 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  53.15 
 
 
370 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.66 
 
 
336 aa  323  5e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  51.8 
 
 
392 aa  322  9.000000000000001e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  50.77 
 
 
336 aa  321  9.999999999999999e-87  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  53.01 
 
 
397 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  53.37 
 
 
373 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  52.85 
 
 
370 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  51.2 
 
 
341 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  49.86 
 
 
397 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  55.49 
 
 
348 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  51.2 
 
 
341 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  53.07 
 
 
373 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>