83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_79956 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  97.78 
 
 		 180 aa  364  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  90.06 
 
 		 182 aa  340  7e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  83.43 
 
 		 181 aa  329  1e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  86.11 
 
 		 183 aa  327  8e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  82.12 
 
 		 184 aa  310  5.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  69.83 
 
 		 182 aa  277  6e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  62.57 
 
 		 185 aa  244  4.9999999999999997e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  58.33 
 
 		 211 aa  234  7e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  61.49 
 
 		 175 aa  230  9e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  56.99 
 
 		 186 aa  223  9e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  60 
 
 		 184 aa  221  6e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  57.07 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  57.54 
 
 		 182 aa  218  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  53.7 
 
 		 162 aa  185  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  45.81 
 
 		 182 aa  174  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  45.24 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  42.07 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  41.4 
 
 		 195 aa  120  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  33.71 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  36.42 
 
 		 179 aa  117  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  35.33 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  34.71 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  35.5 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  36.09 
 
 		 189 aa  107  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  35.88 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  35.33 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  31.25 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  31.25 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  30.99 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  27.07 
 
 		 242 aa  87.4  9e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  30.99 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  34.85 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  38 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  25 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  26.4 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  30.25 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  29.51 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  28.69 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  29.06 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  27.64 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  29.35 
 
 		 205 aa  51.2  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  29.75 
 
 		 203 aa  51.2  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  31.71 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  26.53 
 
 		 387 aa  50.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  26.23 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  26.43 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  27.74 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  25.56 
 
 		 233 aa  48.5  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.51 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  29.41 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  23.4 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  26.27 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  28.57 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  25 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  29.31 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  29.41 
 
 		 211 aa  45.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  22.62 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  29.31 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  29.31 
 
 		 195 aa  44.7  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  29.31 
 
 		 195 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  27.05 
 
 		 187 aa  44.3  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  25.62 
 
 		 229 aa  44.3  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  21.67 
 
 		 885 aa  44.7  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  25.29 
 
 		 291 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  34.12 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  24.37 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  27.06 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  29.41 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  28.45 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  24.82 
 
 		 289 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36721  predicted protein  25 
 
 		 323 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  29.59 
 
 		 424 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.79 
 
 		 1107 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  23.67 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.359872 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  23.33 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.65 
 
 		 863 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  27.64 
 
 		 200 aa  42  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  25.36 
 
 		 214 aa  41.6  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.495831 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  21.95 
 
 		 218 aa  41.2  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  24.39 
 
 		 258 aa  41.2  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3230  small GTP-binding protein  25.87 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.137976 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  31.76 
 
 		 215 aa  40.8  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>