66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0379 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  100 
 
 		 196 aa  401  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  84.1 
 
 		 195 aa  349  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  83.08 
 
 		 195 aa  347  7e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  84.62 
 
 		 195 aa  347  7e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  84.1 
 
 		 195 aa  345  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  85.13 
 
 		 195 aa  344  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  83.08 
 
 		 195 aa  342  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  82.56 
 
 		 195 aa  339  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  79.38 
 
 		 195 aa  328  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  79.38 
 
 		 195 aa  328  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  79.38 
 
 		 195 aa  328  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  79.38 
 
 		 195 aa  329  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  78.87 
 
 		 195 aa  325  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  70.62 
 
 		 194 aa  291  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  62.56 
 
 		 195 aa  254  7e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  61.46 
 
 		 196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  60.94 
 
 		 196 aa  251  7e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  60.2 
 
 		 196 aa  249  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  55.5 
 
 		 191 aa  228  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  56.02 
 
 		 191 aa  228  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  55.5 
 
 		 191 aa  227  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  55.5 
 
 		 352 aa  225  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  55.5 
 
 		 355 aa  225  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  54.69 
 
 		 335 aa  224  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  54.97 
 
 		 356 aa  224  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  54.36 
 
 		 195 aa  222  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  52.33 
 
 		 205 aa  201  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  50 
 
 		 204 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  45.6 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  47.67 
 
 		 205 aa  181  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  44.79 
 
 		 289 aa  181  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  43.75 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  42.71 
 
 		 281 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  41.12 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  41.24 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  41.12 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  44.62 
 
 		 271 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  47.22 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  46.55 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  40.8 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  39.31 
 
 		 214 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  40.96 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  38.54 
 
 		 291 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  36.27 
 
 		 270 aa  117  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  34.64 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0457  small GTP-binding protein  34.11 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0486938 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  29.46 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  30 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1323  small GTP-binding protein  25.71 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.415004  normal  0.083818 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  29.41 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  26.29 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  29.41 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  26.97 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  25.97 
 
 		 387 aa  45.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  26.78 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  28.46 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  26.78 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1892  small GTP-binding protein  25.13 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  26.55 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  28.33 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  26.23 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  25.49 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2576  small GTP-binding protein  27.27 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2206  small GTP-binding protein  27.27 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  normal  0.0744426 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  27.97 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  28.69 
 
 		 824 aa  41.6  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>