55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0968 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  100 
 
 
214 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  53.73 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  49.52 
 
 
223 aa  214  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  41.75 
 
 
230 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  42 
 
 
230 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  42.5 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  41.95 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  40.98 
 
 
220 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  42.7 
 
 
355 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  44.13 
 
 
335 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  42.77 
 
 
195 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  42.7 
 
 
352 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  42.77 
 
 
356 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  42.77 
 
 
195 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  42.2 
 
 
195 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  41.62 
 
 
195 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  42.78 
 
 
205 aa  148  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  41.62 
 
 
195 aa  147  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  42.35 
 
 
191 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  42.33 
 
 
205 aa  145  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  41.62 
 
 
195 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  42.35 
 
 
191 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  40.7 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  41.04 
 
 
195 aa  144  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  42.53 
 
 
195 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  37.36 
 
 
195 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  41.76 
 
 
191 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  39.31 
 
 
196 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  39.88 
 
 
195 aa  141  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  41.38 
 
 
196 aa  141  9e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  40.98 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  41.38 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  39.88 
 
 
195 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  39.88 
 
 
195 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  39.88 
 
 
195 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  39.88 
 
 
195 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  35.05 
 
 
204 aa  126  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  35.71 
 
 
289 aa  124  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  34.44 
 
 
305 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  33.86 
 
 
289 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  33.68 
 
 
281 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  32.24 
 
 
291 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  32.76 
 
 
293 aa  89  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  29.13 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  25 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0708  GTP-binding protein LepA  27.08 
 
 
611 aa  48.5  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0389521  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1191  GTP-binding protein LepA  25.13 
 
 
620 aa  45.1  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.859695  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2371  GTP-binding protein LepA  29.85 
 
 
604 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1397  GTP-binding protein LepA  26.56 
 
 
600 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1118  GTP-binding protein LepA  26.56 
 
 
600 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0932  GTP-binding protein LepA  23.44 
 
 
610 aa  42.7  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0636523  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0765  GTP-binding protein LepA  24.03 
 
 
607 aa  42.4  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0150789  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1009  GTP-binding protein LepA  25.17 
 
 
607 aa  42  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1210  GTP-binding protein LepA  25.87 
 
 
607 aa  41.6  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0906  GTP-binding protein LepA  23.44 
 
 
610 aa  41.6  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>