44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1322 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  100 
 
 
270 aa  555  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  43.59 
 
 
289 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  42.19 
 
 
291 aa  155  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  40.81 
 
 
293 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  33.56 
 
 
289 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  40.41 
 
 
281 aa  142  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  36.27 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  36.08 
 
 
195 aa  116  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  34.72 
 
 
195 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  34.72 
 
 
195 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  34.72 
 
 
195 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  35.05 
 
 
305 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  34.2 
 
 
195 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  34 
 
 
195 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  34.72 
 
 
195 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  34.2 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  33.33 
 
 
196 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  36.5 
 
 
195 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  33.85 
 
 
195 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  36.5 
 
 
195 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  36.5 
 
 
195 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  33.16 
 
 
196 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  35.77 
 
 
195 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  31.79 
 
 
195 aa  99.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  31.79 
 
 
194 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  32.63 
 
 
196 aa  96.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  33 
 
 
335 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  33.66 
 
 
356 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  37.96 
 
 
352 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  37.96 
 
 
355 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  35.57 
 
 
205 aa  92.4  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  29.02 
 
 
191 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  28.5 
 
 
191 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  30.39 
 
 
204 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  29.8 
 
 
191 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  32.31 
 
 
271 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  31.12 
 
 
230 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  30.61 
 
 
230 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  30.61 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  26.02 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  29.13 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  25.58 
 
 
225 aa  63.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  24.88 
 
 
223 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  26.6 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>