46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3475 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  67.59 
 
 		 223 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  53.73 
 
 		 214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  48 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  46.89 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  45 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  45.18 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  44.67 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  46.67 
 
 		 195 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  43.32 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  45.56 
 
 		 195 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  46.11 
 
 		 195 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  53.38 
 
 		 352 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  45.56 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  53.38 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  46.55 
 
 		 196 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  45.56 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  43.33 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  52.7 
 
 		 356 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  42.86 
 
 		 335 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  43.33 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  43.33 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  43.33 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  45.56 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  44.57 
 
 		 195 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  43.89 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  45.3 
 
 		 196 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  45.71 
 
 		 196 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  43.82 
 
 		 194 aa  145  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  43.55 
 
 		 205 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  45.71 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  41.62 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  37.7 
 
 		 191 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  37.19 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  44.6 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  34.05 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  32.56 
 
 		 305 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  33.16 
 
 		 281 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  33.51 
 
 		 289 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  32.46 
 
 		 293 aa  104  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  31.89 
 
 		 291 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  25.58 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  31.07 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  29.55 
 
 		 387 aa  41.6  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>