47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1154 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  100 
 
 
356 aa  696    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  96.07 
 
 
355 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  95.22 
 
 
352 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  70.31 
 
 
335 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  58.12 
 
 
195 aa  245  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  58.64 
 
 
195 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  57.59 
 
 
195 aa  242  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  57.59 
 
 
195 aa  242  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  57.07 
 
 
195 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  57.07 
 
 
195 aa  238  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  56.54 
 
 
195 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  57.07 
 
 
195 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  57.07 
 
 
195 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  57.07 
 
 
195 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  55.5 
 
 
195 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  56.02 
 
 
195 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  56.54 
 
 
194 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  54.97 
 
 
196 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  54.45 
 
 
191 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  54.45 
 
 
191 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  54.08 
 
 
195 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  51.83 
 
 
191 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  53.3 
 
 
196 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  52.38 
 
 
196 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  53.97 
 
 
196 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  50.51 
 
 
205 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  49.74 
 
 
195 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  44.22 
 
 
205 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  44.22 
 
 
204 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  46.41 
 
 
223 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  45.03 
 
 
305 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  41.67 
 
 
271 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  43.75 
 
 
230 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  43.75 
 
 
230 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  44.33 
 
 
220 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  43.23 
 
 
230 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  52.7 
 
 
225 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  40.57 
 
 
289 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  42.77 
 
 
214 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  41.97 
 
 
289 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  42.55 
 
 
281 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  38.33 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  33.66 
 
 
270 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  32.37 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  27.22 
 
 
387 aa  47  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  29.59 
 
 
161 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>