51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2372 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  100 
 
 
204 aa  420  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  58.16 
 
 
205 aa  246  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  53.23 
 
 
205 aa  232  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  52.53 
 
 
195 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  52.53 
 
 
195 aa  203  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  51.52 
 
 
195 aa  203  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  52.53 
 
 
195 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  51.52 
 
 
195 aa  202  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  51.52 
 
 
195 aa  201  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  51.02 
 
 
196 aa  201  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  51.52 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  51.27 
 
 
195 aa  198  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  51.3 
 
 
196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  50 
 
 
196 aa  194  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  47.47 
 
 
196 aa  193  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  50 
 
 
195 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  50 
 
 
195 aa  192  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  50 
 
 
195 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  50 
 
 
195 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  50 
 
 
195 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  48.98 
 
 
191 aa  191  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  47.98 
 
 
194 aa  190  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  48.47 
 
 
191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  45.23 
 
 
335 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  46.46 
 
 
195 aa  179  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  46.94 
 
 
191 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  43.72 
 
 
355 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  44.22 
 
 
356 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  43.72 
 
 
352 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  42.13 
 
 
289 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  40.3 
 
 
305 aa  151  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  42.49 
 
 
281 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  39.5 
 
 
271 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  39.18 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  37.38 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  38.66 
 
 
230 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  38.66 
 
 
230 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  36.5 
 
 
220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  36.18 
 
 
289 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  37.19 
 
 
225 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  35.05 
 
 
214 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  35.23 
 
 
293 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  32.66 
 
 
291 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  30.39 
 
 
270 aa  87.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  29.61 
 
 
187 aa  58.5  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  28.02 
 
 
161 aa  48.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  24.86 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  24.04 
 
 
387 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0253  protein of unknown function, ATP binding  26.28 
 
 
182 aa  42  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  28.57 
 
 
176 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  26.49 
 
 
177 aa  41.2  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>