52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1908 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  89.97 
 
 		 289 aa  511  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  45.25 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  44.21 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  42.36 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  45.83 
 
 		 195 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  45.83 
 
 		 195 aa  185  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  43.59 
 
 		 195 aa  178  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  43.75 
 
 		 195 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  44.27 
 
 		 195 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  44.04 
 
 		 195 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  44.27 
 
 		 195 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  43.75 
 
 		 195 aa  175  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  45.13 
 
 		 195 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  45.13 
 
 		 195 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  45.13 
 
 		 195 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  47.09 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  42.71 
 
 		 196 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  43.59 
 
 		 195 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  45.92 
 
 		 196 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  46.84 
 
 		 196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  43.62 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  41.15 
 
 		 194 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  42.49 
 
 		 204 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  35.66 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  39.15 
 
 		 195 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  40.93 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  40.21 
 
 		 191 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  39.68 
 
 		 191 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  42.55 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  42.02 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  42.02 
 
 		 352 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  38.86 
 
 		 205 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  35.98 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  36.79 
 
 		 195 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  36.27 
 
 		 205 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  37.23 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  36.7 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  36.17 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  36.7 
 
 		 271 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  34.05 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  33.33 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  31.4 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  25.97 
 
 		 174 aa  52.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  29.02 
 
 		 330 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  27.7 
 
 		 193 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  28.5 
 
 		 330 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2576  small GTP-binding protein  26.02 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2206  small GTP-binding protein  26.02 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  normal  0.0744426 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  26.58 
 
 		 192 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3637  hypothetical protein  24.07 
 
 		 218 aa  42  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>