52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4477 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  100 
 
 
230 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  98.7 
 
 
230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  96.96 
 
 
230 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  85.2 
 
 
271 aa  390  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  41.51 
 
 
223 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  46.77 
 
 
220 aa  187  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  45 
 
 
225 aa  180  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  45.16 
 
 
195 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  41.24 
 
 
196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  44.62 
 
 
195 aa  165  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  41.95 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  43.55 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  41.62 
 
 
194 aa  162  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  44.81 
 
 
195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  45.16 
 
 
195 aa  162  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  43.23 
 
 
355 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  43.23 
 
 
352 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  44.81 
 
 
195 aa  161  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  44.81 
 
 
195 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  43.55 
 
 
195 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  44.81 
 
 
195 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  43.23 
 
 
356 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  44.81 
 
 
195 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  42.64 
 
 
195 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  41.54 
 
 
195 aa  158  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  41.03 
 
 
205 aa  158  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  43.3 
 
 
196 aa  156  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  39.69 
 
 
195 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  43.81 
 
 
335 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  41.71 
 
 
196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  39.18 
 
 
204 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  41.71 
 
 
196 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  38.27 
 
 
205 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  40.76 
 
 
195 aa  138  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  38.89 
 
 
191 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  38.89 
 
 
191 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  36.24 
 
 
305 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  38.22 
 
 
289 aa  135  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  38.33 
 
 
191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  35.96 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  38.25 
 
 
281 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  34.72 
 
 
291 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  31.72 
 
 
293 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  30.61 
 
 
270 aa  85.5  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  24.44 
 
 
174 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  26.09 
 
 
187 aa  46.2  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1509  GTP-binding protein LepA  25.81 
 
 
606 aa  45.4  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.783077  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  28.49 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2061  GTP-binding protein LepA  27.03 
 
 
602 aa  43.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  28.26 
 
 
176 aa  42.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2045  GTP-binding protein LepA  29.69 
 
 
601 aa  42  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  28.26 
 
 
176 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>