More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1509 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1266  GTP-binding protein LepA  53.77 
 
 
600 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00508967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1431  GTP-binding protein LepA  50.17 
 
 
599 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04711  GTP-binding protein LepA  53.27 
 
 
602 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.772575  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1893  GTP-binding protein LepA  53.81 
 
 
601 aa  677    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000413124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1152  GTP-binding protein LepA  53.68 
 
 
607 aa  676    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1466  GTP-binding protein LepA  51.49 
 
 
601 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0477  GTP-binding protein LepA  51.17 
 
 
598 aa  645    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0305047  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1324  GTP-binding protein LepA  51.58 
 
 
613 aa  659    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4400  GTP-binding protein LepA  54.35 
 
 
607 aa  701    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.751687  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0906  GTP-binding protein LepA  55.33 
 
 
610 aa  698    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1039  GTP-binding protein LepA  51.5 
 
 
602 aa  653    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1346  GTP-binding protein LepA  50.92 
 
 
596 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4220  GTP-binding protein LepA  50.75 
 
 
595 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.438138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4218  GTP-binding protein LepA  54.18 
 
 
607 aa  699    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00198782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4056  GTP-binding protein LepA  54.18 
 
 
607 aa  699    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000612977  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl473  GTP-binding protein LepA  53.49 
 
 
600 aa  649    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4066  GTP-binding protein LepA  54.18 
 
 
607 aa  699    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0084757  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0541  GTP-binding protein LepA  52.59 
 
 
597 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.270144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1837  GTP-binding protein LepA  50.25 
 
 
610 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1834  GTP-binding protein LepA  50.08 
 
 
610 aa  638    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3954  GTP-binding protein LepA  51.08 
 
 
598 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0036  GTP-binding protein LepA  51.17 
 
 
599 aa  655    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0829  GTP-binding protein LepA  51.49 
 
 
614 aa  672    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1754  GTP-binding protein LepA  52.68 
 
 
603 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.570485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2255  GTP-binding protein LepA  51.75 
 
 
597 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.357862  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0343  GTP-binding protein LepA  51.84 
 
 
603 aa  656    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.697436  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0440  GTP-binding protein LepA  53.18 
 
 
603 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239909  normal  0.261131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2897  GTP-binding protein LepA  52.59 
 
 
597 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2461  GTP-binding protein LepA  50.08 
 
 
606 aa  641    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0992  GTP-binding protein LepA  51.58 
 
 
598 aa  651    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.376719  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3270  GTP-binding protein LepA  51.9 
 
 
602 aa  643    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.13221 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1618  GTP-binding protein LepA  51.93 
 
 
599 aa  656    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000183904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4244  GTP-binding protein LepA  52.09 
 
 
597 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1471  GTP-binding protein LepA  54.01 
 
 
605 aa  681    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472946  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1582  GTP-binding protein LepA  52.09 
 
 
602 aa  640    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.314683  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0490  GTP-binding protein LepA  53.32 
 
 
605 aa  684    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0799  GTP-binding protein LepA  52.26 
 
 
606 aa  649    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.274116  normal  0.0311101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1766  GTP-binding protein LepA  52.76 
 
 
629 aa  663    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000017953  normal  0.0160194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2817  GTP-binding protein LepA  51.67 
 
 
601 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4544  GTP-binding protein LepA  54.01 
 
 
607 aa  698    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0416  GTP-binding protein LepA  53.27 
 
 
602 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0479  GTP-binding protein LepA  53.01 
 
 
604 aa  659    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1751  GTP-binding protein LepA  53.94 
 
 
597 aa  667    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.951642  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0321  GTP-binding protein LepA  53.65 
 
 
600 aa  644    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0581  GTP-binding protein LepA  55.18 
 
 
602 aa  696    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.810707  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1728  GTP-binding protein LepA  52.75 
 
 
597 aa  641    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1614  GTP-binding protein LepA  52.09 
 
 
601 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1262  GTP-binding protein LepA  50.67 
 
 
682 aa  645    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0559574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0469  GTP-binding protein LepA  52.01 
 
 
644 aa  636    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.942925  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2781  GTP-binding protein LepA  52.59 
 
 
597 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3064  GTP-binding protein LepA  50.99 
 
 
603 aa  635    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128095  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20941  GTP-binding protein LepA  51.17 
 
 
604 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812482 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0860  GTP-binding protein LepA  52.6 
 
 
597 aa  645    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0198649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1004  GTP-binding protein LepA  52.6 
 
 
597 aa  645    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0141271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3638  GTP-binding protein LepA  51.82 
 
 
603 aa  641    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492611  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1083  GTP-binding protein LepA  52.25 
 
 
597 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.632342  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2768  GTP-binding protein LepA  51.76 
 
 
596 aa  646    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000363833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0373  GTP-binding protein LepA  52.34 
 
 
644 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.598212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3444  GTP-binding protein LepA  53.01 
 
 
603 aa  662    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0438  GTP-binding protein LepA  52.84 
 
 
610 aa  664    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.587658  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2421  GTP-binding protein LepA  51.59 
 
 
597 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.417593  normal  0.344469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0244  GTP-binding protein LepA  54.29 
 
 
601 aa  673    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1624  GTP-binding protein LepA  53.27 
 
 
595 aa  651    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.440773  normal  0.182126 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0647  GTP-binding protein LepA  50.08 
 
 
604 aa  641    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2813  GTP-binding protein LepA  52.59 
 
 
597 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0652  GTP-binding protein LepA  52.25 
 
 
597 aa  638    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3241  GTP-binding protein LepA  50.75 
 
 
602 aa  636    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1516  GTP-binding protein LepA  51.26 
 
 
600 aa  636    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2468  GTP-binding protein LepA  52.59 
 
 
597 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4075  GTP-binding protein LepA  51.93 
 
 
605 aa  657    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1717  GTP-binding protein LepA  53.34 
 
 
596 aa  662    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000391378  normal  0.794394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2295  GTP-binding protein LepA  55.85 
 
 
600 aa  685    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2010  GTP-binding protein LepA  55.69 
 
 
600 aa  684    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2425  GTP-binding protein LepA  52.51 
 
 
601 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2850  GTP-binding protein LepA  50.59 
 
 
596 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2932  GTP-binding protein LepA  50.59 
 
 
596 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000771458  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1344  GTP-binding protein LepA  51 
 
 
627 aa  657    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.269651  normal  0.813727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2931  GTP-binding protein LepA  52.09 
 
 
596 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0135754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1583  GTP-binding protein LepA  53.34 
 
 
599 aa  669    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0013667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0148  GTP-binding protein LepA  49.92 
 
 
608 aa  644    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1008  GTP-binding protein LepA  52.09 
 
 
597 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54370  GTP-binding protein LepA  51.41 
 
 
599 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1210  GTP-binding protein LepA  55.52 
 
 
607 aa  693    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0581  GTP-binding protein LepA  53.17 
 
 
623 aa  641    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0824  GTP-binding protein LepA  51.92 
 
 
612 aa  660    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1191  GTP-binding protein LepA  52 
 
 
620 aa  655    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.859695  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0932  GTP-binding protein LepA  55.17 
 
 
610 aa  701    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0636523  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1199  GTP-binding protein LepA  51.76 
 
 
596 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000113159  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1132  GTP-binding protein LepA  52.25 
 
 
597 aa  638    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0905  GTP-binding protein LepA  50.5 
 
 
598 aa  635    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3028  GTP-binding protein LepA  50.75 
 
 
596 aa  636    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000110121  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0778  GTP-binding protein LepA  52.17 
 
 
606 aa  656    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0607569  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2331  GTP-binding protein LepA  52 
 
 
598 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1859  GTP-binding protein LepA  53.17 
 
 
605 aa  669    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.365032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1326  GTP-binding protein LepA  54.94 
 
 
603 aa  667    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.450194  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1891  GTP-binding protein LepA  50.58 
 
 
635 aa  654    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.647784  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04741  GTP-binding protein LepA  52.84 
 
 
603 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04811  GTP-binding protein LepA  52.76 
 
 
602 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.469061  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3881  GTP-binding protein LepA  50.67 
 
 
652 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.288489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2261  GTP-binding protein LepA  52.17 
 
 
607 aa  672    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>