More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0906 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1266  GTP-binding protein LepA  62.08 
 
 
600 aa  793    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00508967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1431  GTP-binding protein LepA  59.7 
 
 
599 aa  753    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1241  GTP-binding protein LepA  57.82 
 
 
595 aa  733    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1893  GTP-binding protein LepA  56.62 
 
 
601 aa  721    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000413124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1152  GTP-binding protein LepA  72.82 
 
 
607 aa  931    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1466  GTP-binding protein LepA  58.36 
 
 
601 aa  741    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0477  GTP-binding protein LepA  57.98 
 
 
598 aa  745    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0305047  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1060  GTP-binding protein LepA  60.3 
 
 
598 aa  737    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.568837 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4400  GTP-binding protein LepA  76.44 
 
 
607 aa  976    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.751687  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4124  GTP-binding protein LepA  57.89 
 
 
596 aa  722    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0906  GTP-binding protein LepA  100 
 
 
610 aa  1241    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1039  GTP-binding protein LepA  60.2 
 
 
602 aa  759    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1346  GTP-binding protein LepA  58.72 
 
 
596 aa  740    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4220  GTP-binding protein LepA  58.85 
 
 
595 aa  742    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.438138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4218  GTP-binding protein LepA  76.28 
 
 
607 aa  976    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00198782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4056  GTP-binding protein LepA  76.44 
 
 
607 aa  976    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000612977  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl473  GTP-binding protein LepA  63.88 
 
 
600 aa  805    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4066  GTP-binding protein LepA  76.44 
 
 
607 aa  976    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0084757  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0541  GTP-binding protein LepA  60.74 
 
 
597 aa  759    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.270144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1837  GTP-binding protein LepA  59.93 
 
 
610 aa  764    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1834  GTP-binding protein LepA  59.76 
 
 
610 aa  762    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3954  GTP-binding protein LepA  58.52 
 
 
598 aa  737    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0330  GTP-binding protein LepA  57.84 
 
 
598 aa  728    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2026  GTP-binding protein LepA  60.57 
 
 
596 aa  761    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.788972  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0829  GTP-binding protein LepA  61.55 
 
 
614 aa  753    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1754  GTP-binding protein LepA  59.9 
 
 
603 aa  762    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.570485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2255  GTP-binding protein LepA  60.57 
 
 
597 aa  756    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.357862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2089  GTP-binding protein LepA  59.97 
 
 
599 aa  751    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0343  GTP-binding protein LepA  56.54 
 
 
603 aa  726    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.697436  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0440  GTP-binding protein LepA  62.12 
 
 
603 aa  781    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239909  normal  0.261131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2897  GTP-binding protein LepA  60.74 
 
 
597 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2461  GTP-binding protein LepA  59.43 
 
 
606 aa  748    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0992  GTP-binding protein LepA  58.68 
 
 
598 aa  743    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.376719  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2088  GTP-binding protein LepA  58.18 
 
 
599 aa  742    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1618  GTP-binding protein LepA  60.97 
 
 
599 aa  764    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000183904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4244  GTP-binding protein LepA  60.4 
 
 
597 aa  780    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1471  GTP-binding protein LepA  58.89 
 
 
605 aa  739    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472946  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1582  GTP-binding protein LepA  61.85 
 
 
602 aa  781    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.314683  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0490  GTP-binding protein LepA  61.07 
 
 
605 aa  763    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0799  GTP-binding protein LepA  61.85 
 
 
606 aa  780    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.274116  normal  0.0311101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1766  GTP-binding protein LepA  61.24 
 
 
629 aa  790    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000017953  normal  0.0160194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2817  GTP-binding protein LepA  62.77 
 
 
601 aa  797    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0732  GTP-binding protein LepA  60.36 
 
 
601 aa  725    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000481242  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4544  GTP-binding protein LepA  76.44 
 
 
607 aa  977    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0416  GTP-binding protein LepA  61.11 
 
 
602 aa  761    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0479  GTP-binding protein LepA  64.31 
 
 
604 aa  805    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1751  GTP-binding protein LepA  59.56 
 
 
597 aa  777    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.951642  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0321  GTP-binding protein LepA  63.04 
 
 
600 aa  788    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3365  GTP-binding protein LepA  58.56 
 
 
621 aa  727    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0581  GTP-binding protein LepA  67.12 
 
 
602 aa  846    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.810707  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1728  GTP-binding protein LepA  60.91 
 
 
597 aa  758    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1614  GTP-binding protein LepA  61.69 
 
 
601 aa  776    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1262  GTP-binding protein LepA  60.03 
 
 
682 aa  738    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0559574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3431  GTP-binding protein LepA  59.6 
 
 
599 aa  759    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116192  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1740  GTP-binding protein LepA  58.67 
 
 
603 aa  726    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0723803  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2246  GTP-binding protein LepA  58.35 
 
 
599 aa  737    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0860  GTP-binding protein LepA  59.73 
 
 
597 aa  753    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0198649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1004  GTP-binding protein LepA  59.73 
 
 
597 aa  753    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0141271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3638  GTP-binding protein LepA  60.73 
 
 
603 aa  744    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492611  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1083  GTP-binding protein LepA  60.07 
 
 
597 aa  778    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.632342  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2768  GTP-binding protein LepA  58.56 
 
 
596 aa  737    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000363833  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0438  GTP-binding protein LepA  56.74 
 
 
610 aa  732    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.587658  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0364  GTP-binding protein LepA  57.84 
 
 
598 aa  728    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2421  GTP-binding protein LepA  60.57 
 
 
597 aa  762    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.417593  normal  0.344469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0244  GTP-binding protein LepA  60.34 
 
 
601 aa  767    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1624  GTP-binding protein LepA  61.78 
 
 
595 aa  741    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.440773  normal  0.182126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0678  GTP-binding protein LepA  59.5 
 
 
599 aa  748    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0691872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0652  GTP-binding protein LepA  60.91 
 
 
597 aa  759    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3493  GTP-binding protein LepA  59.43 
 
 
639 aa  741    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105385  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3151  GTP-binding protein LepA  60.07 
 
 
598 aa  738    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000523336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4075  GTP-binding protein LepA  58.46 
 
 
605 aa  748    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1717  GTP-binding protein LepA  59.06 
 
 
596 aa  747    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000391378  normal  0.794394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2295  GTP-binding protein LepA  64.21 
 
 
600 aa  797    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2010  GTP-binding protein LepA  64.05 
 
 
600 aa  796    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1242  GTP-binding protein LepA  58.96 
 
 
598 aa  738    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2425  GTP-binding protein LepA  60.71 
 
 
601 aa  765    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2850  GTP-binding protein LepA  58.89 
 
 
596 aa  742    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2932  GTP-binding protein LepA  58.89 
 
 
596 aa  742    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000771458  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1344  GTP-binding protein LepA  61.01 
 
 
627 aa  773    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.269651  normal  0.813727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2931  GTP-binding protein LepA  58.05 
 
 
596 aa  736    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0135754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1583  GTP-binding protein LepA  61.37 
 
 
599 aa  771    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0013667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0148  GTP-binding protein LepA  58.89 
 
 
608 aa  750    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1008  GTP-binding protein LepA  60.4 
 
 
597 aa  755    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54370  GTP-binding protein LepA  59.36 
 
 
599 aa  752    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1210  GTP-binding protein LepA  88.14 
 
 
607 aa  1112    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0581  GTP-binding protein LepA  63.89 
 
 
623 aa  810    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0824  GTP-binding protein LepA  66.72 
 
 
612 aa  862    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1191  GTP-binding protein LepA  71.99 
 
 
620 aa  927    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.859695  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0932  GTP-binding protein LepA  95.89 
 
 
610 aa  1199    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0636523  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2240  GTP-binding protein LepA  57.69 
 
 
617 aa  724    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.191927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1132  GTP-binding protein LepA  60.91 
 
 
597 aa  759    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0905  GTP-binding protein LepA  61.85 
 
 
598 aa  780    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3028  GTP-binding protein LepA  58.72 
 
 
596 aa  741    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000110121  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0778  GTP-binding protein LepA  60.58 
 
 
606 aa  736    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0607569  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2331  GTP-binding protein LepA  61.62 
 
 
598 aa  770    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1859  GTP-binding protein LepA  60.17 
 
 
605 aa  757    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.365032  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4417  GTP-binding protein LepA  57.84 
 
 
614 aa  735    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558912  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1891  GTP-binding protein LepA  59.7 
 
 
635 aa  751    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.647784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3556  GTP-binding protein LepA  59.43 
 
 
639 aa  741    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3881  GTP-binding protein LepA  59.1 
 
 
652 aa  743    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.288489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>