59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2940 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  100 
 
 
195 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  90.77 
 
 
195 aa  371  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  90.26 
 
 
195 aa  370  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  90.77 
 
 
195 aa  371  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  90.26 
 
 
195 aa  370  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  89.23 
 
 
195 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  88.72 
 
 
195 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  82.56 
 
 
196 aa  339  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  81.44 
 
 
195 aa  332  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  80.41 
 
 
195 aa  328  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  79.9 
 
 
195 aa  329  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  80.41 
 
 
195 aa  328  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  80.41 
 
 
195 aa  328  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  74.74 
 
 
194 aa  305  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  63.27 
 
 
196 aa  251  5.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  62.96 
 
 
196 aa  248  4e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  62.43 
 
 
196 aa  244  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  57.59 
 
 
352 aa  242  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  57.59 
 
 
355 aa  242  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  58.29 
 
 
195 aa  241  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  57.59 
 
 
356 aa  241  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  56.02 
 
 
191 aa  237  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  56.02 
 
 
191 aa  236  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  54.69 
 
 
335 aa  231  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  54.97 
 
 
191 aa  229  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  54.87 
 
 
195 aa  221  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  52.53 
 
 
204 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  51.05 
 
 
205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  44.56 
 
 
305 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  44.79 
 
 
289 aa  180  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  43.23 
 
 
289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  44.27 
 
 
281 aa  177  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  46.63 
 
 
205 aa  177  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  45.56 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  45.16 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  44.44 
 
 
230 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  44.26 
 
 
230 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  43.68 
 
 
223 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  44.09 
 
 
271 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  43.89 
 
 
225 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  41.62 
 
 
214 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  40.43 
 
 
293 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  38.02 
 
 
291 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  36.08 
 
 
270 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  32.76 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  29.31 
 
 
161 aa  49.7  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  29.66 
 
 
183 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0457  small GTP-binding protein  28.26 
 
 
168 aa  45.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0486938 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  28.57 
 
 
182 aa  45.4  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  27.43 
 
 
387 aa  44.7  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  23.89 
 
 
176 aa  44.7  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0379  small GTP-binding protein  25.9 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  26.09 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0801  GTP-binding protein LepA  30.4 
 
 
618 aa  43.5  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.799005 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  29.27 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  28.45 
 
 
181 aa  43.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  28.57 
 
 
181 aa  42  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  28.45 
 
 
180 aa  42.4  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2195  GTP-binding protein LepA  32 
 
 
596 aa  41.6  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0205071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>