45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0659 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  100 
 
 
293 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  35.41 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  43.62 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  43.62 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  36.64 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  40.72 
 
 
196 aa  155  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  34.67 
 
 
291 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  40.93 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  40.96 
 
 
196 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  40.82 
 
 
196 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  40.96 
 
 
195 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  40.96 
 
 
195 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  40.43 
 
 
195 aa  142  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  39.68 
 
 
195 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  40.43 
 
 
195 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  39.89 
 
 
195 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  40.43 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  39.89 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  39.89 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  40.43 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  39.89 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  38.83 
 
 
195 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  39.06 
 
 
196 aa  136  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  38.22 
 
 
191 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  38.22 
 
 
191 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  40.21 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  39.69 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  37.95 
 
 
195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  36.65 
 
 
191 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  39.69 
 
 
352 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  40.59 
 
 
335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  37.23 
 
 
194 aa  125  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  35.98 
 
 
195 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  35.23 
 
 
204 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  34.5 
 
 
205 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  32.47 
 
 
223 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  32.46 
 
 
225 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  33.68 
 
 
271 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  29.65 
 
 
205 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  31.73 
 
 
220 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  32.76 
 
 
214 aa  89  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  31.72 
 
 
230 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  31.72 
 
 
230 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  31.72 
 
 
230 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0873  GTP-binding protein, putative  40 
 
 
416 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>