55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1713 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  92.31 
 
 
196 aa  374  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  81.87 
 
 
196 aa  323  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  60.71 
 
 
195 aa  254  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  61.46 
 
 
196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  64.55 
 
 
194 aa  253  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  64.55 
 
 
195 aa  252  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  64.55 
 
 
195 aa  251  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  63.49 
 
 
195 aa  251  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  60.71 
 
 
195 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  63.49 
 
 
195 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  62.96 
 
 
195 aa  248  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  63.49 
 
 
195 aa  248  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  60.2 
 
 
195 aa  247  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  60.2 
 
 
195 aa  247  6e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  62.96 
 
 
195 aa  247  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  60.2 
 
 
195 aa  247  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  56.77 
 
 
191 aa  230  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  56.25 
 
 
191 aa  229  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  56.92 
 
 
195 aa  225  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  55.44 
 
 
195 aa  224  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  53.12 
 
 
191 aa  221  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  55.03 
 
 
335 aa  214  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  51.02 
 
 
204 aa  201  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  52.38 
 
 
356 aa  197  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  51.85 
 
 
355 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  51.85 
 
 
352 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  47.96 
 
 
205 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  44.39 
 
 
305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  43.43 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  45.41 
 
 
289 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  45.92 
 
 
281 aa  168  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  41.27 
 
 
289 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  43.65 
 
 
220 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  42.54 
 
 
223 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  41.85 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  41.71 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  45.71 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  41.71 
 
 
230 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  41.71 
 
 
271 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  40.82 
 
 
293 aa  144  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  40.98 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  36.32 
 
 
291 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  33.16 
 
 
270 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  28.33 
 
 
174 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  30.43 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  26.7 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0457  small GTP-binding protein  29.08 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0486938 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  28.23 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  22.7 
 
 
176 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  23.93 
 
 
176 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0253  protein of unknown function, ATP binding  22.58 
 
 
182 aa  42.4  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3915  protein of unknown function, ATP binding  25.41 
 
 
177 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13398  ATP/GTP-binding protein  26.15 
 
 
193 aa  41.6  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00758  normal  0.0959612 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  24.87 
 
 
177 aa  41.6  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>