66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6866 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  100 
 
 
195 aa  401  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  86.67 
 
 
195 aa  357  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  86.67 
 
 
195 aa  357  6e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  86.67 
 
 
195 aa  357  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  86.15 
 
 
195 aa  355  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  82.47 
 
 
195 aa  340  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  82.47 
 
 
195 aa  338  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  82.47 
 
 
195 aa  337  8e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  81.44 
 
 
195 aa  336  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  81.96 
 
 
195 aa  335  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  80.93 
 
 
195 aa  329  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  79.9 
 
 
195 aa  329  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  78.87 
 
 
196 aa  325  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  73.2 
 
 
194 aa  292  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  60.82 
 
 
196 aa  256  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  60.71 
 
 
196 aa  254  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  59.16 
 
 
191 aa  251  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  59.16 
 
 
191 aa  249  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  60.94 
 
 
196 aa  249  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  58.64 
 
 
191 aa  249  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  57.44 
 
 
195 aa  238  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  55.73 
 
 
335 aa  234  8e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  55.5 
 
 
352 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  55.5 
 
 
356 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  55.5 
 
 
355 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  54.59 
 
 
195 aa  226  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  50 
 
 
204 aa  192  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  50.53 
 
 
205 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  45.13 
 
 
305 aa  185  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  44.62 
 
 
289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  43.59 
 
 
281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  46.32 
 
 
205 aa  174  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  42.71 
 
 
289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  43.32 
 
 
225 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  40.41 
 
 
223 aa  160  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  40.93 
 
 
271 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  40.21 
 
 
230 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  40.21 
 
 
230 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  39.69 
 
 
230 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  41.67 
 
 
220 aa  147  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  39.88 
 
 
214 aa  141  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  39.68 
 
 
293 aa  141  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  38.02 
 
 
291 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  34.2 
 
 
270 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  32.18 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0457  small GTP-binding protein  30.07 
 
 
168 aa  51.6  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0486938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  27.97 
 
 
161 aa  47.8  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4170  GTP-binding protein LepA  30.68 
 
 
607 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000794546  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3046  GTP-binding protein LepA  30.68 
 
 
608 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000105213  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4400  GTP-binding protein LepA  30.11 
 
 
607 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.751687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4218  GTP-binding protein LepA  30.11 
 
 
607 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00198782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4452  GTP-binding protein LepA  30.11 
 
 
607 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000544374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4438  GTP-binding protein LepA  30.11 
 
 
607 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000191799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0798  GTP-binding protein LepA  30.11 
 
 
607 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330002  hitchhiker  1.66538e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4341  GTP-binding protein LepA  30.11 
 
 
607 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50936e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4056  GTP-binding protein LepA  30.11 
 
 
607 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000612977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4544  GTP-binding protein LepA  30.11 
 
 
607 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4066  GTP-binding protein LepA  30.11 
 
 
607 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0084757  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1210  GTP-binding protein LepA  30.11 
 
 
607 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2026  GTP-binding protein LepA  26.6 
 
 
596 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.788972  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0708  GTP-binding protein LepA  30.68 
 
 
611 aa  42  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0389521  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1017  small GTP-binding protein  26.71 
 
 
158 aa  41.6  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0956  small GTP-binding protein  26.03 
 
 
157 aa  41.2  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740927  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1009  GTP-binding protein LepA  29.71 
 
 
607 aa  41.2  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0860  GTP-binding protein LepA  35.29 
 
 
597 aa  41.2  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0198649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1004  GTP-binding protein LepA  35.29 
 
 
597 aa  41.2  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0141271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>