68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1982 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  590  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  49.33 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  44.91 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  44.01 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  38.61 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  45.31 
 
 		 195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  45.83 
 
 		 195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  44.79 
 
 		 195 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  45.31 
 
 		 195 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  45.31 
 
 		 195 aa  182  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  44.79 
 
 		 195 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  44.79 
 
 		 195 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  44.79 
 
 		 196 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  44.79 
 
 		 195 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  44.79 
 
 		 195 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  43.23 
 
 		 195 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  43.75 
 
 		 195 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  42.71 
 
 		 195 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  41.8 
 
 		 196 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  41.54 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  41.27 
 
 		 196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  39.58 
 
 		 194 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  41.15 
 
 		 196 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  43.59 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  41.78 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  40.57 
 
 		 355 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  40.57 
 
 		 352 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  40.57 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  36.65 
 
 		 191 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  36.65 
 
 		 191 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  36.65 
 
 		 191 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  36.98 
 
 		 195 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  37.44 
 
 		 195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  39.79 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  38.22 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  38.22 
 
 		 230 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  37.7 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  36.18 
 
 		 204 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  38.42 
 
 		 205 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  35.71 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  35.15 
 
 		 205 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  34.05 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  31.86 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  35.08 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  33.85 
 
 		 182 aa  50.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  28.48 
 
 		 192 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  26.28 
 
 		 190 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  28.77 
 
 		 193 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4144  GTP-binding protein Obg/CgtA  30 
 
 		 368 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  25.25 
 
 		 183 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2045  GTP-binding protein LepA  29.13 
 
 		 601 aa  45.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  29.5 
 
 		 213 aa  45.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  25.37 
 
 		 180 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  23.72 
 
 		 211 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  25.54 
 
 		 203 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2070  GTP-binding protein LepA  27.54 
 
 		 595 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.282271  normal  0.186175 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  23.73 
 
 		 175 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.96 
 
 		 435 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  24.82 
 
 		 181 aa  43.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  29.76 
 
 		 427 aa  43.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  30.19 
 
 		 182 aa  43.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  25 
 
 		 184 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  25.56 
 
 		 174 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  25.52 
 
 		 189 aa  42.7  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  33.71 
 
 		 189 aa  42.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  26.14 
 
 		 206 aa  42.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  26.83 
 
 		 185 aa  42.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0778  GTP-binding protein LepA  32.65 
 
 		 606 aa  42.4  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0607569  normal  0.011752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>