80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG03220 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  91.57 
 
 		 180 aa  341  4e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  90.06 
 
 		 181 aa  340  7e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  83.98 
 
 		 181 aa  329  1e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  85.47 
 
 		 183 aa  322  3e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  81.42 
 
 		 184 aa  313  9.999999999999999e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  69.66 
 
 		 182 aa  275  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  62.84 
 
 		 185 aa  251  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  57.14 
 
 		 211 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  59.2 
 
 		 175 aa  223  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  58.06 
 
 		 186 aa  223  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  60 
 
 		 184 aa  220  9e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  56.59 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  57.8 
 
 		 185 aa  211  7e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  53.7 
 
 		 162 aa  187  5.999999999999999e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  43.41 
 
 		 182 aa  167  6e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  46.01 
 
 		 187 aa  154  9e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  44.03 
 
 		 184 aa  149  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  40.76 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  33.71 
 
 		 177 aa  117  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  34.52 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  40.74 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  35.09 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  36.31 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  35.29 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  35.29 
 
 		 189 aa  104  9e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  32.75 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  32.75 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  35.88 
 
 		 193 aa  95.1  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  32.93 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  27.31 
 
 		 242 aa  85.5  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  31.61 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  40.86 
 
 		 276 aa  77.8  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  34.38 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  25 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  27.2 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  28.67 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  29.41 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  28.77 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  29.51 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  30.58 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  28.21 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  29.35 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0208811 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  26.71 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  26.23 
 
 		 252 aa  50.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  26.61 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  25.74 
 
 		 233 aa  48.5  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.61 
 
 		 165 aa  48.5  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  26.09 
 
 		 258 aa  48.1  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  23.4 
 
 		 208 aa  47.8  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  25.51 
 
 		 387 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  27.96 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  27.27 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  27.17 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  26.27 
 
 		 215 aa  45.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 		 240 aa  45.4  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  28.78 
 
 		 229 aa  44.7  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.14 
 
 		 1107 aa  44.7  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  28.71 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  24.36 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  27.05 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3230  small GTP-binding protein  25.17 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.137976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  26.14 
 
 		 867 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  21.67 
 
 		 885 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  34.88 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  29.06 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  29.06 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  28.21 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  29.41 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  30.19 
 
 		 289 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  28.33 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  29.06 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  20.73 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  25.2 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  27.5 
 
 		 220 aa  42  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  26.35 
 
 		 516 aa  42  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36721  predicted protein  24.09 
 
 		 323 aa  42  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  24.62 
 
 		 291 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  21.95 
 
 		 218 aa  41.6  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  31.76 
 
 		 215 aa  41.2  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>