43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH02300 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  100 
 
 		 223 aa  461  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  30.81 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  48.31 
 
 		 276 aa  92.4  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  35.86 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  39.39 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  35.38 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  34.85 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  35.94 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  35.61 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  36.36 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  36.92 
 
 		 175 aa  81.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  34.38 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  34.85 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  34.85 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  35.59 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  30.83 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  33.33 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  32.03 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  32.33 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  32 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  31.38 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  31.06 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  27.32 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  32.59 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  34.58 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  28.79 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  31.06 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  31.06 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  32.35 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  33.61 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  28.57 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  28.57 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  27.42 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  30.4 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  31.2 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36721  predicted protein  37.84 
 
 		 323 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35327  predicted protein  33.7 
 
 		 431 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  27.74 
 
 		 774 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00520  G-protein alpha-subunit  27.27 
 
 		 432 aa  43.5  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.3 
 
 		 434 aa  43.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89074  predicted protein  32.43 
 
 		 445 aa  43.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  29.63 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01016  G protein alpha subunitPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVK8]  25 
 
 		 356 aa  42.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940202  normal  0.412758 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>