43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03430 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  100 
 
 		 189 aa  389  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  79.89 
 
 		 189 aa  322  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  77.49 
 
 		 190 aa  297  6e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  68.23 
 
 		 193 aa  266  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  60.73 
 
 		 192 aa  246  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  39.08 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  36.69 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  36.31 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  38.67 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  36.09 
 
 		 181 aa  107  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  33.72 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  34.3 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  34.1 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  35.26 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  35.29 
 
 		 182 aa  104  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  35.12 
 
 		 180 aa  104  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  34.52 
 
 		 184 aa  102  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  37.59 
 
 		 162 aa  99.4  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  35.23 
 
 		 187 aa  97.8  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  31.69 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  31.93 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  32.76 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  33.73 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  31.18 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  31.58 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  31.58 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  33.59 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  32.31 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  30.59 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  26.97 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  27.32 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  28.5 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  29.2 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  34.09 
 
 		 276 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  27.15 
 
 		 291 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  26.99 
 
 		 305 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  25.53 
 
 		 450 aa  43.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  25.53 
 
 		 450 aa  42.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  25.52 
 
 		 289 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  24.49 
 
 		 469 aa  41.6  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  28.21 
 
 		 233 aa  41.2  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  27.94 
 
 		 458 aa  40.8  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>