77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8659 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  100 
 
 
184 aa  378  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  68.57 
 
 
175 aa  251  4.0000000000000004e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  62.5 
 
 
182 aa  236  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  61.67 
 
 
185 aa  228  4e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  59.36 
 
 
186 aa  224  6e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  60.34 
 
 
181 aa  222  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  60.56 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  60 
 
 
181 aa  221  7e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  60 
 
 
182 aa  220  9e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  59.89 
 
 
184 aa  214  7e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  57.22 
 
 
183 aa  208  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  51.11 
 
 
185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  50 
 
 
182 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  46.7 
 
 
211 aa  186  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  50.93 
 
 
184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  46.67 
 
 
182 aa  169  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  48.78 
 
 
187 aa  160  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  45.28 
 
 
162 aa  151  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  42.51 
 
 
195 aa  130  7.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  39.08 
 
 
189 aa  119  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  33.71 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  37.29 
 
 
192 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  34.66 
 
 
190 aa  107  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  33.14 
 
 
186 aa  105  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  33.14 
 
 
186 aa  105  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  32.73 
 
 
179 aa  102  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  34.71 
 
 
189 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  35.12 
 
 
182 aa  99  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  34.09 
 
 
193 aa  99  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  31.07 
 
 
185 aa  98.2  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  29.82 
 
 
242 aa  89.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  41.12 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  32.69 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  26.15 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  31.06 
 
 
223 aa  60.1  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  29.24 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  26.38 
 
 
208 aa  52  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  27.33 
 
 
208 aa  51.2  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  28.07 
 
 
211 aa  49.7  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  30.59 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  26.19 
 
 
203 aa  49.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  27.97 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  28.57 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  27.78 
 
 
307 aa  49.3  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  27.33 
 
 
203 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  28.57 
 
 
207 aa  48.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  25.61 
 
 
214 aa  47.8  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  27.34 
 
 
205 aa  47.8  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 
450 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  25 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  27.27 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  26.55 
 
 
230 aa  47.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  24.04 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  22.86 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  26.62 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 
450 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  23.74 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  28.33 
 
 
252 aa  46.2  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  27.53 
 
 
844 aa  45.8  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  28.1 
 
 
258 aa  45.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  25.21 
 
 
885 aa  45.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  28.48 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  24.14 
 
 
229 aa  44.7  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36721  predicted protein  29.89 
 
 
323 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  31.68 
 
 
863 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  26.99 
 
 
202 aa  43.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  30.67 
 
 
691 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  25 
 
 
289 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  26.25 
 
 
212 aa  42.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  29.17 
 
 
233 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  30.68 
 
 
445 aa  42.4  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  30.77 
 
 
220 aa  42.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  27.33 
 
 
811 aa  42  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0253  protein of unknown function, ATP binding  24.82 
 
 
182 aa  41.6  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  25.29 
 
 
214 aa  41.2  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  25.61 
 
 
210 aa  40.8  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>