More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0657 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  98 
 
 
450 aa  878    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 
450 aa  893    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  51.33 
 
 
441 aa  432  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  50.66 
 
 
459 aa  414  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  44.09 
 
 
461 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  43.74 
 
 
452 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  45.22 
 
 
461 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  41.65 
 
 
462 aa  369  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  44.09 
 
 
462 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  40.39 
 
 
459 aa  361  1e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  44.3 
 
 
458 aa  361  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  44.03 
 
 
459 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  42.95 
 
 
462 aa  358  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  42.64 
 
 
456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  44.1 
 
 
455 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  40.93 
 
 
454 aa  354  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  44.33 
 
 
458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  42.55 
 
 
455 aa  353  5e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  44.33 
 
 
458 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  42.98 
 
 
458 aa  350  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  40.31 
 
 
458 aa  349  5e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  45.89 
 
 
456 aa  347  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  40.39 
 
 
459 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  40.39 
 
 
459 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  41.65 
 
 
461 aa  347  3e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  43.6 
 
 
460 aa  346  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  41.83 
 
 
463 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  43.79 
 
 
455 aa  344  2e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  43.44 
 
 
461 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 
458 aa  343  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 
458 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 
458 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 
458 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 
458 aa  340  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 
458 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 
458 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 
458 aa  340  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  41.38 
 
 
458 aa  339  5.9999999999999996e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 
458 aa  338  8e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 
458 aa  338  8e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  45.65 
 
 
461 aa  335  9e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  40.96 
 
 
452 aa  334  2e-90  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 
460 aa  334  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  38.86 
 
 
452 aa  332  9e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  38.38 
 
 
464 aa  329  5.0000000000000004e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  38.56 
 
 
467 aa  326  6e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  38.86 
 
 
463 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  41.61 
 
 
459 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  39.7 
 
 
456 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  39.35 
 
 
461 aa  324  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  39.08 
 
 
454 aa  323  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  40.72 
 
 
469 aa  323  4e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  39.69 
 
 
460 aa  320  3e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  40.26 
 
 
457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  41.18 
 
 
459 aa  315  8e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  39.22 
 
 
455 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  42.73 
 
 
447 aa  311  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  41.3 
 
 
446 aa  310  4e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 
461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  38.38 
 
 
460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  39.05 
 
 
455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  38.91 
 
 
461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 
458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  39.66 
 
 
455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  38.19 
 
 
437 aa  306  6e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  37.99 
 
 
460 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 
452 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  37.99 
 
 
460 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  40.83 
 
 
465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  36.98 
 
 
458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 
464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  37.98 
 
 
472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 
462 aa  303  5.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 
471 aa  303  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  40.22 
 
 
455 aa  302  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  39.61 
 
 
455 aa  302  8.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  38.88 
 
 
470 aa  302  8.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  38.56 
 
 
446 aa  302  9e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  40.5 
 
 
449 aa  302  9e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  38.01 
 
 
436 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0018  tRNA modification GTPase TrmE  38.77 
 
 
438 aa  301  2e-80  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  37.45 
 
 
473 aa  300  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  38.3 
 
 
466 aa  300  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  40.83 
 
 
456 aa  300  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  38.56 
 
 
446 aa  299  8e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 
518 aa  298  2e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 
460 aa  297  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  39.07 
 
 
446 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0179  tRNA modification GTPase TrmE  38.61 
 
 
464 aa  294  2e-78  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  37.94 
 
 
457 aa  294  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  39.27 
 
 
455 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  38.29 
 
 
448 aa  294  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 
462 aa  293  6e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2779  tRNA modification GTPase TrmE  37.01 
 
 
473 aa  292  7e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  37.55 
 
 
475 aa  292  8e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  36.77 
 
 
464 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  36.77 
 
 
464 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 
450 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 
462 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  39.09 
 
 
455 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>