More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2669 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  99.78 
 
 
458 aa  903    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 
458 aa  905    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  49.89 
 
 
461 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  50.98 
 
 
458 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  49.68 
 
 
458 aa  455  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  49.89 
 
 
458 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  49.89 
 
 
458 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  49.89 
 
 
458 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  49.89 
 
 
458 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  50.11 
 
 
458 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  49.89 
 
 
458 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  49.68 
 
 
458 aa  455  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  50.54 
 
 
458 aa  455  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  50.54 
 
 
458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  49.13 
 
 
462 aa  451  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  50.97 
 
 
462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  50.65 
 
 
461 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  50.54 
 
 
459 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  49.24 
 
 
456 aa  435  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  50.22 
 
 
460 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  48.91 
 
 
458 aa  431  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  49.35 
 
 
461 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  46.42 
 
 
459 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  47.49 
 
 
463 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  47.4 
 
 
461 aa  421  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  49.46 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  48.47 
 
 
455 aa  410  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  45.67 
 
 
459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  45.67 
 
 
459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  47.62 
 
 
456 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  49.67 
 
 
455 aa  402  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  48.03 
 
 
452 aa  404  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  45.71 
 
 
462 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  44.59 
 
 
454 aa  393  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  46.67 
 
 
460 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  45.53 
 
 
457 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  46 
 
 
458 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  44.09 
 
 
471 aa  375  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  44.44 
 
 
464 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  48.48 
 
 
456 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  43.48 
 
 
463 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  44.52 
 
 
455 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  45.92 
 
 
465 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  45.43 
 
 
461 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  44.52 
 
 
455 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  45.77 
 
 
455 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  44.12 
 
 
469 aa  366  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  44.78 
 
 
459 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  46.65 
 
 
456 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  43.07 
 
 
464 aa  359  5e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  45.02 
 
 
455 aa  358  8e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  41.48 
 
 
460 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  42.89 
 
 
461 aa  352  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  41.7 
 
 
458 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  41.48 
 
 
460 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  41.05 
 
 
460 aa  349  7e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  44.33 
 
 
450 aa  348  1e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  43.07 
 
 
466 aa  348  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 
458 aa  347  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  43.23 
 
 
455 aa  345  8.999999999999999e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  41.03 
 
 
467 aa  345  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  42.36 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  45.39 
 
 
459 aa  342  7e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  44.54 
 
 
450 aa  341  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  41.77 
 
 
460 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  40.39 
 
 
459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  43.5 
 
 
518 aa  334  2e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  44.66 
 
 
452 aa  334  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 
472 aa  331  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  41.9 
 
 
462 aa  329  5.0000000000000004e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  41.4 
 
 
455 aa  329  5.0000000000000004e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  41.38 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  43.11 
 
 
447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  39.56 
 
 
460 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  41.97 
 
 
475 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  40.35 
 
 
475 aa  323  5e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  39.82 
 
 
457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  40.52 
 
 
464 aa  319  5e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  42.7 
 
 
473 aa  319  7e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  42.7 
 
 
452 aa  319  7e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  38.39 
 
 
444 aa  318  1e-85  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 
473 aa  318  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  38.43 
 
 
461 aa  318  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  40.56 
 
 
455 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 
464 aa  315  9e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  41.33 
 
 
473 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  39.14 
 
 
456 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  40.56 
 
 
446 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 
455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  39.32 
 
 
473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0314  tRNA modification GTPase TrmE  37.45 
 
 
450 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00576337  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  39.66 
 
 
459 aa  313  5.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  37.42 
 
 
478 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  41.25 
 
 
456 aa  311  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 
456 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  39.35 
 
 
462 aa  309  6.999999999999999e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  38.91 
 
 
455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  38.96 
 
 
454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  40.96 
 
 
441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  38.7 
 
 
458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>