More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2137 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 461 aa  920    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  55.77 
 
 		 457 aa  461  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  53.42 
 
 		 468 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  54.39 
 
 		 478 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1915  tRNA modification GTPase TrmE  53.16 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.410866  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1965  tRNA modification GTPase TrmE  47.26 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 		 458 aa  347  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  39.08 
 
 		 460 aa  339  8e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  44.1 
 
 		 454 aa  336  3.9999999999999995e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  38.86 
 
 		 461 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  37.28 
 
 		 459 aa  333  5e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  38.71 
 
 		 456 aa  332  1e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  38.34 
 
 		 462 aa  330  4e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 		 455 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  39.08 
 
 		 461 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  38.24 
 
 		 461 aa  329  7e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  42.79 
 
 		 461 aa  328  9e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  43.13 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  40.74 
 
 		 455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 463 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  38.2 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  41.43 
 
 		 462 aa  324  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  38.73 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  36.11 
 
 		 459 aa  323  3e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  38.07 
 
 		 458 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  38.29 
 
 		 458 aa  319  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  37.64 
 
 		 459 aa  319  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  37.64 
 
 		 459 aa  319  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  38.43 
 
 		 458 aa  318  9e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  38.29 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  38.43 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  38.07 
 
 		 458 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  41.65 
 
 		 465 aa  317  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  37.86 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  37.86 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  37.86 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  37.86 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  38.07 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  38.07 
 
 		 458 aa  316  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  39.08 
 
 		 462 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  36.29 
 
 		 461 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  39.47 
 
 		 455 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  39.25 
 
 		 455 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  35.95 
 
 		 460 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  39.27 
 
 		 455 aa  310  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  39.25 
 
 		 456 aa  310  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  38.6 
 
 		 457 aa  306  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  38.73 
 
 		 450 aa  306  6e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  36.9 
 
 		 458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  40.48 
 
 		 436 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  40.64 
 
 		 470 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  41.25 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  39 
 
 		 460 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 456 aa  300  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  39 
 
 		 460 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  37.85 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  39.52 
 
 		 459 aa  298  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  40.69 
 
 		 455 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  40.91 
 
 		 455 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  35.65 
 
 		 455 aa  295  9e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  34.5 
 
 		 452 aa  295  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  38.51 
 
 		 450 aa  294  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  42.7 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  37.88 
 
 		 456 aa  293  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  38.6 
 
 		 454 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  39.64 
 
 		 462 aa  293  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  42.67 
 
 		 452 aa  292  7e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  38.18 
 
 		 464 aa  290  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  38.86 
 
 		 460 aa  289  9e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  39.31 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  38.53 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  38.53 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  37.15 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  38.53 
 
 		 467 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 		 437 aa  288  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  38.53 
 
 		 467 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  38.1 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  37.15 
 
 		 473 aa  288  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  38.53 
 
 		 467 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  38.53 
 
 		 454 aa  286  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  38.53 
 
 		 454 aa  286  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  38.53 
 
 		 454 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  38.53 
 
 		 454 aa  286  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 		 467 aa  286  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  40.87 
 
 		 455 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  38.53 
 
 		 454 aa  286  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  38.36 
 
 		 473 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  40.52 
 
 		 456 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  40.52 
 
 		 456 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  34.98 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  38.71 
 
 		 454 aa  286  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  40.35 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  36.76 
 
 		 475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  38.31 
 
 		 454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  38.31 
 
 		 454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  37.55 
 
 		 460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  38.31 
 
 		 454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  37.58 
 
 		 473 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  39.44 
 
 		 456 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>