More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2025 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2779  tRNA modification GTPase TrmE  72.09 
 
 		 473 aa  657    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 473 aa  944    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  69.49 
 
 		 473 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  68.55 
 
 		 476 aa  638    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  69.63 
 
 		 475 aa  621  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  66.38 
 
 		 473 aa  615  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  66.88 
 
 		 473 aa  600  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  43.47 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  41.52 
 
 		 455 aa  362  6e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  40.65 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  42.64 
 
 		 461 aa  339  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  39.19 
 
 		 469 aa  337  1.9999999999999998e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  39.09 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  42.49 
 
 		 518 aa  332  9e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  41.59 
 
 		 455 aa  332  9e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 456 aa  332  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  41.38 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 472 aa  330  4e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  41.03 
 
 		 455 aa  329  5.0000000000000004e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  38.06 
 
 		 463 aa  329  6e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  41.25 
 
 		 458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  41.38 
 
 		 458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  43.63 
 
 		 462 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  38.83 
 
 		 458 aa  324  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  38.25 
 
 		 466 aa  323  5e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  42.25 
 
 		 462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  37.74 
 
 		 458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  42.4 
 
 		 457 aa  318  9e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  37.98 
 
 		 462 aa  313  4.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  39.06 
 
 		 455 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  43.66 
 
 		 462 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  37.66 
 
 		 460 aa  310  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  41.87 
 
 		 456 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  38 
 
 		 461 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  38.81 
 
 		 458 aa  309  9e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  43.25 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 459 aa  307  3e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  38.68 
 
 		 458 aa  307  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  38.92 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  38.71 
 
 		 458 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  38.92 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  38.92 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  38.92 
 
 		 458 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  38.92 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  38.92 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  38.79 
 
 		 458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  37.88 
 
 		 455 aa  302  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  38.25 
 
 		 458 aa  302  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  39.52 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  42.12 
 
 		 461 aa  300  5e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  40.35 
 
 		 454 aa  299  7e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 		 455 aa  299  8e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  36.93 
 
 		 456 aa  298  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  38.26 
 
 		 444 aa  297  3e-79  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 459 aa  297  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 459 aa  297  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  36.99 
 
 		 459 aa  296  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 		 461 aa  295  8e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  36.42 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  39.31 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  38.09 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 		 452 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  38.03 
 
 		 454 aa  289  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  37.18 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  40.63 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  34.2 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  37.58 
 
 		 461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4384  tRNA modification GTPase TrmE  41.3 
 
 		 479 aa  283  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  39.33 
 
 		 456 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  36.83 
 
 		 450 aa  281  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  36.09 
 
 		 452 aa  280  4e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 		 447 aa  280  4e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 		 456 aa  280  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  36.09 
 
 		 473 aa  280  6e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4791  tRNA modification GTPase TrmE  37.42 
 
 		 482 aa  279  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  37.15 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  40.52 
 
 		 455 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  38.74 
 
 		 478 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  40.34 
 
 		 455 aa  277  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  39.75 
 
 		 466 aa  277  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  38.58 
 
 		 457 aa  277  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 		 464 aa  276  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  38.25 
 
 		 461 aa  276  6e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  38.76 
 
 		 448 aa  276  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1783  tRNA modification GTPase TrmE  36.11 
 
 		 454 aa  276  8e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.028326  normal  0.377376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  38.1 
 
 		 436 aa  276  8e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3495  tRNA modification GTPase TrmE  38.88 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  35.71 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0179  tRNA modification GTPase TrmE  33.97 
 
 		 464 aa  274  3e-72  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  38.44 
 
 		 456 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  40.42 
 
 		 471 aa  272  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  38.44 
 
 		 456 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4138  tRNA modification GTPase TrmE  38.12 
 
 		 486 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.619376  normal  0.415942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  38.53 
 
 		 456 aa  270  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4904  tRNA modification GTPase TrmE  36.77 
 
 		 478 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  38.18 
 
 		 475 aa  269  7e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  38.64 
 
 		 464 aa  269  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>