More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0977 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 447 aa  874    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  43.08 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  41.63 
 
 		 460 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  43.2 
 
 		 464 aa  372  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  41.63 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  40.97 
 
 		 458 aa  356  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  44.54 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  40.91 
 
 		 467 aa  351  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  41.13 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  43.11 
 
 		 458 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  43.11 
 
 		 458 aa  346  6e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  43.29 
 
 		 461 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  40.49 
 
 		 456 aa  342  1e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  41.65 
 
 		 462 aa  338  9e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  40.86 
 
 		 458 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  41.23 
 
 		 460 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0680  tRNA modification GTPase TrmE  42.51 
 
 		 438 aa  338  9.999999999999999e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000180906  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  40.77 
 
 		 458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  39.22 
 
 		 462 aa  338  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  40.77 
 
 		 458 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  41.18 
 
 		 458 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  45.85 
 
 		 459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 		 463 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  40.43 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  40.22 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  40.22 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  40.56 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  40.56 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  40.56 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  39.66 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  40.56 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  39.29 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  43.51 
 
 		 459 aa  329  7e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  37.74 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  40.34 
 
 		 462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  42.17 
 
 		 460 aa  326  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  38.95 
 
 		 456 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  40.48 
 
 		 455 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  38.95 
 
 		 455 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  39.69 
 
 		 455 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  37.96 
 
 		 459 aa  323  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  37.96 
 
 		 459 aa  323  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5212  tRNA modification GTPase TrmE  39.08 
 
 		 456 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  39.29 
 
 		 458 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  39.86 
 
 		 455 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 		 456 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  39.08 
 
 		 456 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  42.73 
 
 		 450 aa  320  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  42.95 
 
 		 450 aa  320  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  38.86 
 
 		 456 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  41.29 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  41.45 
 
 		 460 aa  320  3e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  42.42 
 
 		 455 aa  320  3e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  39.34 
 
 		 461 aa  320  5e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  38.65 
 
 		 456 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  38.65 
 
 		 456 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  42.92 
 
 		 455 aa  319  6e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  36.32 
 
 		 462 aa  319  6e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  39.56 
 
 		 475 aa  319  7e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  38.8 
 
 		 455 aa  319  7e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  43.04 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  42.55 
 
 		 452 aa  316  4e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  42.55 
 
 		 473 aa  316  5e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  38.77 
 
 		 455 aa  315  7e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  37.94 
 
 		 456 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  39.69 
 
 		 452 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  38.38 
 
 		 455 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 		 464 aa  312  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  38.85 
 
 		 461 aa  312  7.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 		 460 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  39.17 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  40.52 
 
 		 461 aa  311  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  39.16 
 
 		 454 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  36.51 
 
 		 450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  38.71 
 
 		 453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  38.6 
 
 		 459 aa  308  9e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  37.72 
 
 		 454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  38.55 
 
 		 448 aa  307  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  38.06 
 
 		 454 aa  307  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  42.18 
 
 		 446 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 		 465 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4062  tRNA modification GTPase TrmE  39.35 
 
 		 453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112278  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  35.39 
 
 		 451 aa  306  7e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  37.85 
 
 		 454 aa  305  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  38.85 
 
 		 458 aa  305  8.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  38.05 
 
 		 456 aa  305  8.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  38.39 
 
 		 446 aa  305  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  42.52 
 
 		 446 aa  305  9.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  36.66 
 
 		 454 aa  305  9.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  39.57 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4928  tRNA modification GTPase TrmE  38.28 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0035842  hitchhiker  0.00000248868 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  38.12 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  38.31 
 
 		 462 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  41.03 
 
 		 461 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  37.44 
 
 		 452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  39.32 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4378  tRNA modification GTPase TrmE  38.28 
 
 		 453 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0292979  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  38.9 
 
 		 449 aa  303  6.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>