More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0100 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  68.09 
 
 		 473 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2779  tRNA modification GTPase TrmE  71.24 
 
 		 473 aa  654    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 473 aa  957    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  66.88 
 
 		 473 aa  620  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  64.69 
 
 		 473 aa  610  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  63.73 
 
 		 476 aa  606  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  66.17 
 
 		 475 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  43.8 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  42.21 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  41.56 
 
 		 461 aa  360  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  41.85 
 
 		 455 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  41.56 
 
 		 466 aa  352  5.9999999999999994e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  42.14 
 
 		 472 aa  352  8.999999999999999e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  40.47 
 
 		 469 aa  350  4e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  41.85 
 
 		 456 aa  349  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  41.54 
 
 		 455 aa  349  6e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  41.35 
 
 		 518 aa  340  4e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 458 aa  328  9e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  40.76 
 
 		 456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  41.44 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  38.27 
 
 		 457 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 		 461 aa  319  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  40.64 
 
 		 462 aa  319  7.999999999999999e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 461 aa  319  9e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  35.84 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  38.46 
 
 		 461 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  35.39 
 
 		 463 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  36.4 
 
 		 461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  34.26 
 
 		 459 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  37.84 
 
 		 455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  42.7 
 
 		 462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  36.8 
 
 		 455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  39.07 
 
 		 436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  37 
 
 		 455 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  42.33 
 
 		 456 aa  305  8.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  39.53 
 
 		 454 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  37.26 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  37.79 
 
 		 460 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  35.97 
 
 		 458 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  38.25 
 
 		 462 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  35.07 
 
 		 462 aa  300  3e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 459 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  38.2 
 
 		 452 aa  297  3e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 		 456 aa  297  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  38.2 
 
 		 473 aa  296  4e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  37.82 
 
 		 446 aa  296  7e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  37.08 
 
 		 455 aa  296  8e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  37.8 
 
 		 456 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  34.85 
 
 		 456 aa  295  1e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  35.68 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 455 aa  293  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  37.95 
 
 		 475 aa  293  5e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  35.68 
 
 		 458 aa  293  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  37.85 
 
 		 456 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  37.95 
 
 		 446 aa  292  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  37.37 
 
 		 456 aa  292  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 447 aa  290  3e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  37.29 
 
 		 457 aa  289  8e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1783  tRNA modification GTPase TrmE  37.1 
 
 		 454 aa  289  8e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.028326  normal  0.377376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  38.28 
 
 		 455 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4904  tRNA modification GTPase TrmE  37.7 
 
 		 478 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  35.16 
 
 		 460 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6055  tRNA modification GTPase TrmE  38.73 
 
 		 473 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  37.2 
 
 		 455 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  32.41 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  36.97 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3495  tRNA modification GTPase TrmE  38.56 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  35.53 
 
 		 458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  35.46 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  35.47 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  35.53 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  35.46 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  35.46 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  35.46 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  35.46 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  35.88 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  35.88 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4241  tRNA modification GTPase TrmE  36.81 
 
 		 469 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207719  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4791  tRNA modification GTPase TrmE  37.1 
 
 		 482 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  36.03 
 
 		 446 aa  283  5.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4138  tRNA modification GTPase TrmE  38.22 
 
 		 486 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.619376  normal  0.415942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5298  tRNA modification GTPase TrmE  38.65 
 
 		 471 aa  282  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  36 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  38.65 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  36.27 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  36 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  36 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  33.82 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 463 aa  280  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  35.9 
 
 		 454 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  35.9 
 
 		 454 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  33.26 
 
 		 459 aa  280  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  33.26 
 
 		 459 aa  280  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  36.75 
 
 		 450 aa  279  6e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  36.75 
 
 		 458 aa  280  6e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0884  tRNA modification GTPase TrmE  37.55 
 
 		 452 aa  279  9e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  35.82 
 
 		 464 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0179  tRNA modification GTPase TrmE  34.32 
 
 		 464 aa  278  1e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>