More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2930 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 
458 aa  924    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  47.07 
 
 
461 aa  448  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  48.26 
 
 
463 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  45.79 
 
 
458 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  48.03 
 
 
459 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  45.57 
 
 
458 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  45.57 
 
 
458 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  45.57 
 
 
458 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  45.57 
 
 
458 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  45.57 
 
 
458 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  45.36 
 
 
458 aa  425  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  45.57 
 
 
458 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  45.57 
 
 
458 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  47.05 
 
 
460 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  45.89 
 
 
461 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  47.61 
 
 
460 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  45.14 
 
 
458 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  45.14 
 
 
458 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  43.26 
 
 
459 aa  421  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  46.29 
 
 
462 aa  421  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  45.63 
 
 
455 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  45.71 
 
 
462 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  44.96 
 
 
455 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  46.22 
 
 
462 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  46.64 
 
 
461 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  44.96 
 
 
455 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  44.76 
 
 
458 aa  408  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  45.61 
 
 
455 aa  410  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  43.98 
 
 
456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  43.48 
 
 
459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  43.48 
 
 
459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  45.49 
 
 
461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  45.2 
 
 
456 aa  402  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  44.57 
 
 
461 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  43.33 
 
 
457 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  44.16 
 
 
454 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  46.02 
 
 
461 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  46 
 
 
458 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  46 
 
 
458 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  48.91 
 
 
456 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  40.96 
 
 
460 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  44.98 
 
 
455 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  45.55 
 
 
455 aa  371  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  42.33 
 
 
452 aa  372  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  43.23 
 
 
458 aa  372  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  42.17 
 
 
464 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  44.06 
 
 
459 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  41.7 
 
 
463 aa  363  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  41.25 
 
 
462 aa  363  4e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  39.78 
 
 
458 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  44.3 
 
 
450 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  42.01 
 
 
465 aa  354  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  40.26 
 
 
454 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  40.7 
 
 
460 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  42.98 
 
 
456 aa  354  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  40.7 
 
 
460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  44.52 
 
 
450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  40.78 
 
 
460 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  43.7 
 
 
452 aa  350  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  40.56 
 
 
459 aa  350  4e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  40.47 
 
 
471 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 
461 aa  347  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  40.72 
 
 
464 aa  345  7e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  39.7 
 
 
473 aa  345  8e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  42.89 
 
 
449 aa  342  1e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  41.45 
 
 
455 aa  335  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  41.48 
 
 
460 aa  332  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  38.81 
 
 
467 aa  330  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 
468 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  38.81 
 
 
473 aa  330  4e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 
452 aa  329  6e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  40.65 
 
 
464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 
464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  42.05 
 
 
455 aa  327  3e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  39.52 
 
 
461 aa  327  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 
476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  39.12 
 
 
458 aa  325  8.000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  41.18 
 
 
447 aa  325  9e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  40.22 
 
 
456 aa  324  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  39.29 
 
 
451 aa  320  3e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  38.31 
 
 
446 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  37.74 
 
 
473 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  37.55 
 
 
475 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  36.92 
 
 
437 aa  318  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  38.92 
 
 
470 aa  317  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  40.39 
 
 
459 aa  316  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  40.08 
 
 
466 aa  315  8e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  38.83 
 
 
455 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2779  tRNA modification GTPase TrmE  36.85 
 
 
473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  38.84 
 
 
450 aa  313  4.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  37.32 
 
 
478 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0884  tRNA modification GTPase TrmE  40.48 
 
 
452 aa  313  5.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  38.07 
 
 
457 aa  312  9e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  37.88 
 
 
456 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  38 
 
 
469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  37.09 
 
 
475 aa  310  4e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  36.46 
 
 
444 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  37.31 
 
 
458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  37.1 
 
 
472 aa  306  7e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  38.03 
 
 
518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>