More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_4024 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 458 aa  919    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  93.23 
 
 		 458 aa  861    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  93.01 
 
 		 458 aa  863    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  74.57 
 
 		 462 aa  692    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  93.67 
 
 		 458 aa  866    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  93.67 
 
 		 458 aa  866    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  93.67 
 
 		 458 aa  867    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  93.23 
 
 		 458 aa  863    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  93.67 
 
 		 458 aa  868    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  93.67 
 
 		 458 aa  866    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  93.67 
 
 		 458 aa  866    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  93.67 
 
 		 458 aa  867    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  75.05 
 
 		 461 aa  724    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  64.05 
 
 		 459 aa  632  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  64.92 
 
 		 459 aa  610  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  64.92 
 
 		 459 aa  610  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  62.23 
 
 		 462 aa  607  9.999999999999999e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  62.53 
 
 		 458 aa  590  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  62.31 
 
 		 456 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  59.3 
 
 		 455 aa  563  1.0000000000000001e-159  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  57.77 
 
 		 461 aa  549  1e-155  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  52.49 
 
 		 460 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  50.33 
 
 		 458 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  48.46 
 
 		 459 aa  455  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  50.11 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  47.06 
 
 		 461 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  48.03 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  47.92 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  47.49 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  45.79 
 
 		 458 aa  435  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  45.45 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  45.67 
 
 		 461 aa  411  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  45.61 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  44.08 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  44.59 
 
 		 462 aa  398  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  46.09 
 
 		 459 aa  398  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  44.32 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  44.42 
 
 		 464 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  45.59 
 
 		 457 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  46.17 
 
 		 465 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  42.92 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  43.1 
 
 		 452 aa  385  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  42.17 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  42.45 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  42.45 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  41.58 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  43.04 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  42.95 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  41.89 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  43.17 
 
 		 455 aa  362  6e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  41.7 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  41.23 
 
 		 454 aa  359  6e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  41.48 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 467 aa  355  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  45 
 
 		 456 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  41.05 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  43.79 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  40.31 
 
 		 450 aa  343  5e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  39.57 
 
 		 458 aa  339  7e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  44.96 
 
 		 452 aa  336  5e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  39.17 
 
 		 460 aa  333  5e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  38.9 
 
 		 452 aa  332  6e-90  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  40.91 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  38.21 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  37.17 
 
 		 464 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  39.96 
 
 		 455 aa  330  3e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  39.47 
 
 		 455 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  37.17 
 
 		 464 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf755  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  38.73 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  40.9 
 
 		 471 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  39.66 
 
 		 447 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 		 455 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  39.07 
 
 		 473 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  41.49 
 
 		 464 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  36.78 
 
 		 452 aa  319  5e-86  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  37.74 
 
 		 469 aa  318  9e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  36.58 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 456 aa  315  9e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  38.68 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 466 aa  307  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0018  tRNA modification GTPase TrmE  36.92 
 
 		 438 aa  306  7e-82  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  37.55 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  38.83 
 
 		 454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  38.79 
 
 		 462 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  38.12 
 
 		 473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  36.8 
 
 		 468 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  36.59 
 
 		 460 aa  302  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  36.59 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 		 452 aa  301  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  36.85 
 
 		 470 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 460 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  38.74 
 
 		 475 aa  297  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  36.54 
 
 		 459 aa  296  5e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  37.63 
 
 		 472 aa  295  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  36.91 
 
 		 450 aa  295  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  36.06 
 
 		 478 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27541  tRNA modification GTPase TrmE  38.58 
 
 		 465 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>