More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_23560 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 463 aa  924    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  53.33 
 
 		 461 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  51.09 
 
 		 461 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  52.28 
 
 		 459 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  49.56 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  49.78 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  48.47 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  49.67 
 
 		 460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  48.03 
 
 		 458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  47.82 
 
 		 458 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  48.26 
 
 		 458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  47.82 
 
 		 458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  46.29 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  47.16 
 
 		 458 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  47.16 
 
 		 458 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  47.16 
 
 		 458 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  47.16 
 
 		 458 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  47.16 
 
 		 458 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  47.16 
 
 		 458 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  47.16 
 
 		 458 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  46.02 
 
 		 462 aa  438  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  47.6 
 
 		 459 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  47.6 
 
 		 459 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  46.62 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  46.17 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  47.49 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  47.28 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  45.47 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  46.19 
 
 		 458 aa  408  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  44.98 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  45.53 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  45.63 
 
 		 455 aa  411  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  46.51 
 
 		 455 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  45.32 
 
 		 456 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  44.23 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  44.66 
 
 		 456 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  46.42 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  44.35 
 
 		 464 aa  398  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  44.01 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  44.06 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  43.17 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  44.23 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  44.44 
 
 		 457 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  40.34 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  40.86 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  44.61 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  44.59 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  40.99 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  40.99 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  45.22 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  41.7 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  42.89 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  41.34 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  41.34 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  41 
 
 		 460 aa  360  4e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  40.48 
 
 		 467 aa  355  5.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  42.36 
 
 		 456 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  41.42 
 
 		 464 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  41.2 
 
 		 464 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  38.12 
 
 		 473 aa  341  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  41.61 
 
 		 450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  40.55 
 
 		 464 aa  338  9e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  39.57 
 
 		 475 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  38.64 
 
 		 469 aa  335  1e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  41.83 
 
 		 450 aa  335  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  37.74 
 
 		 461 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  39.44 
 
 		 444 aa  333  3e-90  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 471 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 461 aa  333  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  38.07 
 
 		 458 aa  330  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  38.06 
 
 		 473 aa  329  8e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  38.43 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  43.14 
 
 		 452 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  40.89 
 
 		 460 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 		 437 aa  325  8.000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  37.99 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 452 aa  324  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2180  tRNA modification GTPase TrmE  41.06 
 
 		 472 aa  323  3e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  40.44 
 
 		 460 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 476 aa  323  5e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  38.65 
 
 		 457 aa  322  6e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  39 
 
 		 454 aa  322  6e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 459 aa  322  9.000000000000001e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  38.43 
 
 		 455 aa  322  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  37.18 
 
 		 466 aa  321  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  37.86 
 
 		 455 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  39.66 
 
 		 461 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  40.22 
 
 		 447 aa  317  3e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  38.74 
 
 		 458 aa  317  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  38.67 
 
 		 450 aa  316  6e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  38.82 
 
 		 452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  38.82 
 
 		 473 aa  314  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  37.69 
 
 		 473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  38.53 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  37.83 
 
 		 451 aa  312  7.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  36.71 
 
 		 470 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  36.91 
 
 		 472 aa  310  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 		 455 aa  311  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  37.98 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 		 462 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>