More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1409 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 452 aa  912    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  43.74 
 
 		 450 aa  366  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  44.18 
 
 		 450 aa  363  4e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  46.29 
 
 		 459 aa  362  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  45.03 
 
 		 441 aa  347  3e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  41.04 
 
 		 461 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 		 458 aa  329  6e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  41.08 
 
 		 458 aa  326  6e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  42.27 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  38.89 
 
 		 457 aa  323  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 454 aa  323  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  39.14 
 
 		 462 aa  322  7e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 460 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  38.49 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  38.83 
 
 		 455 aa  319  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  38.92 
 
 		 455 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 		 462 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  38.26 
 
 		 462 aa  317  3e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  38.63 
 
 		 465 aa  316  5e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  39.22 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 		 459 aa  313  5.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  39.49 
 
 		 461 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  41.42 
 
 		 459 aa  310  5e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  40.51 
 
 		 455 aa  307  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  36.97 
 
 		 456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  38.66 
 
 		 459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  38.61 
 
 		 458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  38.61 
 
 		 458 aa  305  7e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  41.01 
 
 		 452 aa  302  6.000000000000001e-81  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  38.46 
 
 		 459 aa  303  6.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  38.78 
 
 		 461 aa  300  3e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  39.13 
 
 		 456 aa  300  4e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 		 459 aa  299  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 		 459 aa  299  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 464 aa  299  7e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  37.09 
 
 		 458 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  39.22 
 
 		 455 aa  298  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  38.96 
 
 		 458 aa  297  3e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  37.74 
 
 		 458 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 461 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  36.98 
 
 		 458 aa  295  8e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 		 458 aa  295  9e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  40.22 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 		 471 aa  293  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  36.6 
 
 		 458 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  36.6 
 
 		 455 aa  293  6e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 		 458 aa  292  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 		 458 aa  292  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  39.22 
 
 		 461 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 		 458 aa  292  9e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 		 458 aa  292  9e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 		 458 aa  292  9e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 		 458 aa  292  9e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  37.8 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  38.55 
 
 		 461 aa  289  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  34.71 
 
 		 458 aa  289  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  35.34 
 
 		 473 aa  287  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  41.56 
 
 		 456 aa  286  5.999999999999999e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  39.17 
 
 		 447 aa  286  7e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf755  tRNA modification GTPase TrmE  38.73 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  34.2 
 
 		 473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  35.04 
 
 		 460 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  34.43 
 
 		 454 aa  283  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  34.72 
 
 		 454 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  33.55 
 
 		 462 aa  281  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  34.05 
 
 		 460 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  34.5 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  35.21 
 
 		 461 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  33.62 
 
 		 464 aa  280  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  34.5 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  37.99 
 
 		 452 aa  280  4e-74  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  34.83 
 
 		 460 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  36.15 
 
 		 452 aa  280  5e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  33.48 
 
 		 436 aa  279  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  34.13 
 
 		 464 aa  279  7e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  32.68 
 
 		 461 aa  279  8e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  36.77 
 
 		 449 aa  279  8e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  33.98 
 
 		 460 aa  279  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  35.6 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2180  tRNA modification GTPase TrmE  36.52 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  34.06 
 
 		 454 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  34.06 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  35.82 
 
 		 455 aa  276  5e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  34.06 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  34.06 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  34.28 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 		 437 aa  276  6e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  34.06 
 
 		 454 aa  276  8e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  34.06 
 
 		 454 aa  276  8e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  34.06 
 
 		 454 aa  276  8e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  34.06 
 
 		 454 aa  276  8e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 455 aa  275  9e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  33.84 
 
 		 467 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  33.11 
 
 		 454 aa  274  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  34.72 
 
 		 456 aa  274  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  33.84 
 
 		 454 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  33.84 
 
 		 454 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 		 466 aa  273  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>