More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0375 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 459 aa  907    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  55.8 
 
 		 441 aa  479  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  50.66 
 
 		 450 aa  425  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  50.88 
 
 		 450 aa  420  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  46.29 
 
 		 452 aa  381  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  45.39 
 
 		 458 aa  361  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  45.39 
 
 		 458 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 454 aa  356  5e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  43.13 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  39 
 
 		 463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  43.57 
 
 		 455 aa  339  7e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  38.18 
 
 		 467 aa  338  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  39 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  38.29 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  38.71 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  38.51 
 
 		 460 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  45.85 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  38.26 
 
 		 464 aa  333  4e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  39.13 
 
 		 462 aa  332  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  39.57 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  41.81 
 
 		 459 aa  325  9e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  38.74 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  39.19 
 
 		 462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  38.7 
 
 		 462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  45.57 
 
 		 456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  37.97 
 
 		 437 aa  319  6e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  36.6 
 
 		 458 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  42.61 
 
 		 455 aa  317  3e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  39.31 
 
 		 458 aa  315  8e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 459 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  41.24 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  36.54 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  36.82 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  37.01 
 
 		 462 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  37.64 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  36.6 
 
 		 458 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  38.55 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  36.6 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  39.12 
 
 		 455 aa  311  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  36.6 
 
 		 458 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  36.6 
 
 		 458 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  36.6 
 
 		 458 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  36.6 
 
 		 458 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  36.6 
 
 		 458 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  40.96 
 
 		 461 aa  310  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  38.07 
 
 		 458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  36.38 
 
 		 458 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 		 460 aa  309  9e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  36.3 
 
 		 459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  39.22 
 
 		 464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  36.3 
 
 		 459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  37.69 
 
 		 458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 		 464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  38.7 
 
 		 459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  38.24 
 
 		 461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  38.11 
 
 		 455 aa  307  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  38.05 
 
 		 452 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  39.06 
 
 		 460 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 		 460 aa  300  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  34.73 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  38.23 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  40.13 
 
 		 469 aa  298  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  41.42 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  37 
 
 		 455 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  37.44 
 
 		 456 aa  297  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  39.07 
 
 		 455 aa  296  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  36.77 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  35.75 
 
 		 450 aa  293  4e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  38.02 
 
 		 460 aa  290  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  38.1 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf755  tRNA modification GTPase TrmE  40.62 
 
 		 442 aa  290  4e-77  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  37.09 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  38.38 
 
 		 461 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  39.92 
 
 		 466 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  37.91 
 
 		 452 aa  286  4e-76  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 452 aa  286  4e-76  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  35.95 
 
 		 462 aa  285  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  36.38 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  36.46 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0680  tRNA modification GTPase TrmE  38.95 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000180906  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  36.98 
 
 		 455 aa  281  1e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  35.31 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  35.23 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 460 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  37.02 
 
 		 460 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  36.07 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  32.96 
 
 		 462 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  38.43 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  35.24 
 
 		 446 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  37.15 
 
 		 448 aa  277  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  35.18 
 
 		 458 aa  276  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  35.46 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  34.34 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  36.57 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49818  predicted protein  36.97 
 
 		 525 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  34.76 
 
 		 464 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  35.26 
 
 		 455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3756  tRNA modification GTPase TrmE  34.42 
 
 		 468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043106 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0018  tRNA modification GTPase TrmE  39.47 
 
 		 438 aa  273  3e-72  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>