More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_02071 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  98.04 
 
 		 460 aa  893    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  96.09 
 
 		 460 aa  829    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  74.84 
 
 		 461 aa  701    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 460 aa  910    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  47.85 
 
 		 464 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  47.85 
 
 		 464 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  46.09 
 
 		 455 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27541  tRNA modification GTPase TrmE  42.25 
 
 		 465 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  39.7 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  39.55 
 
 		 451 aa  378  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  38.66 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  39.28 
 
 		 464 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  39.09 
 
 		 450 aa  375  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  38.66 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  38.91 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 467 aa  353  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  38.73 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  41.16 
 
 		 463 aa  332  8e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  41.43 
 
 		 459 aa  317  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  39.15 
 
 		 460 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  36.02 
 
 		 458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  36.02 
 
 		 458 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  36.02 
 
 		 458 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 		 458 aa  312  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  36.02 
 
 		 458 aa  312  9e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  36.02 
 
 		 458 aa  312  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  36.02 
 
 		 458 aa  312  9e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  36.02 
 
 		 458 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  35.96 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  37.15 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  40.3 
 
 		 461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  38.56 
 
 		 461 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  37.37 
 
 		 458 aa  305  9.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  36.29 
 
 		 462 aa  304  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  36.65 
 
 		 462 aa  302  8.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  36.91 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  35.53 
 
 		 455 aa  300  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  35.29 
 
 		 456 aa  296  8e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 		 475 aa  295  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  34.87 
 
 		 455 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 456 aa  293  6e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  38.22 
 
 		 460 aa  289  9e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  38.6 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  40.38 
 
 		 458 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  40.38 
 
 		 458 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  35.57 
 
 		 455 aa  286  7e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  35.22 
 
 		 455 aa  286  7e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  37.5 
 
 		 459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  35.39 
 
 		 462 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  33.84 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  32.27 
 
 		 459 aa  279  6e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  35.62 
 
 		 459 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  35.93 
 
 		 460 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  37.76 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  35.68 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  34.49 
 
 		 450 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  33.9 
 
 		 466 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  35.87 
 
 		 456 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  34.84 
 
 		 454 aa  273  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  35.73 
 
 		 461 aa  272  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  36.32 
 
 		 452 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  34.1 
 
 		 462 aa  272  8.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  35.36 
 
 		 455 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  34.78 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  35.43 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  33.05 
 
 		 457 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  34.71 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  37.8 
 
 		 458 aa  272  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  35.04 
 
 		 450 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3612  tRNA modification GTPase TrmE  36.46 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  33.26 
 
 		 461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  35.27 
 
 		 454 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3774  tRNA modification GTPase TrmE  35.84 
 
 		 466 aa  270  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0161001  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  33.04 
 
 		 461 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  35.14 
 
 		 454 aa  269  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  35.05 
 
 		 454 aa  269  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  35.05 
 
 		 454 aa  269  8.999999999999999e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4001  tRNA modification GTPase TrmE  36.13 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73411  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  32.77 
 
 		 473 aa  267  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  35.91 
 
 		 441 aa  266  4e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0005  tRNA modification GTPase TrmE  35.65 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135343  hitchhiker  0.00000014804 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  35.43 
 
 		 453 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  34.92 
 
 		 454 aa  266  8e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  35.14 
 
 		 454 aa  265  8.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  35.43 
 
 		 453 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  34.63 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  35.33 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  36.49 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  36.75 
 
 		 472 aa  265  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  35.22 
 
 		 453 aa  264  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  32.48 
 
 		 459 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  35.36 
 
 		 458 aa  265  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  36.3 
 
 		 460 aa  265  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4062  tRNA modification GTPase TrmE  35.42 
 
 		 453 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>