More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3641 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 460 aa  905    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  53.26 
 
 		 457 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  52.17 
 
 		 456 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  53.36 
 
 		 455 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  52.71 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  49.57 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  51.96 
 
 		 456 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  43.17 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  43.7 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  43.04 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  43.26 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  41.52 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  43.26 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  43.7 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  43.7 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  43.7 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  43.48 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  43.7 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  40.74 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  43.7 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  42.61 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  41.63 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  46.2 
 
 		 461 aa  372  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  43.26 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  39.52 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  41.74 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  41.74 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  43.48 
 
 		 462 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  42.23 
 
 		 456 aa  360  3e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  41.43 
 
 		 463 aa  358  8e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  41.3 
 
 		 458 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 		 461 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  45.47 
 
 		 454 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  41.83 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  41.83 
 
 		 458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  39.01 
 
 		 460 aa  353  4e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  44.09 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  40.31 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  41.36 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  43.89 
 
 		 460 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  43.89 
 
 		 460 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  42.36 
 
 		 458 aa  339  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  40.6 
 
 		 461 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  44.59 
 
 		 462 aa  337  3.9999999999999995e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  43.17 
 
 		 464 aa  335  7e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  43.53 
 
 		 462 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  47.61 
 
 		 452 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  37.69 
 
 		 455 aa  330  2e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  44.23 
 
 		 464 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  39 
 
 		 458 aa  327  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  43.01 
 
 		 460 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 444 aa  322  7e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  44.28 
 
 		 461 aa  322  8e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  41.36 
 
 		 467 aa  321  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 		 455 aa  317  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  44.07 
 
 		 471 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  42.52 
 
 		 465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 455 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  41.44 
 
 		 473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  40.3 
 
 		 458 aa  312  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  38.29 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  43.93 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  41.25 
 
 		 454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  36.76 
 
 		 469 aa  306  6e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  39.57 
 
 		 461 aa  306  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  40.96 
 
 		 457 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  40.85 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  40.85 
 
 		 473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 		 456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  40.9 
 
 		 470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  38.64 
 
 		 455 aa  302  7.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  37.84 
 
 		 459 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  42.52 
 
 		 455 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 450 aa  297  3e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  35.81 
 
 		 466 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  38.48 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  40.25 
 
 		 475 aa  294  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  38.14 
 
 		 473 aa  293  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 437 aa  292  7e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  42.27 
 
 		 446 aa  292  7e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  39.31 
 
 		 473 aa  292  8e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  38.86 
 
 		 461 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  37.97 
 
 		 472 aa  291  1e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1915  tRNA modification GTPase TrmE  43.2 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.410866  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 450 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  39.52 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  43.21 
 
 		 478 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2779  tRNA modification GTPase TrmE  38.09 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  38.92 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  42.04 
 
 		 456 aa  285  9e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  41.88 
 
 		 456 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  41.88 
 
 		 456 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1965  tRNA modification GTPase TrmE  38.49 
 
 		 468 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  40.18 
 
 		 450 aa  283  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 458 aa  282  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  44.11 
 
 		 462 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  34.48 
 
 		 452 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  41.67 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>