More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_27541 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  75.22 
 
 		 450 aa  635    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27541  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 465 aa  916    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  71.24 
 
 		 451 aa  624  1e-177  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  60.56 
 
 		 455 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  58.41 
 
 		 464 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  58.84 
 
 		 464 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  52.4 
 
 		 460 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  51.2 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  52.18 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  49.36 
 
 		 464 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  50 
 
 		 458 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  52.17 
 
 		 460 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  40.9 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  46.91 
 
 		 467 aa  420  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  42.15 
 
 		 460 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  50.22 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  42.15 
 
 		 460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  41.94 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  38.72 
 
 		 461 aa  330  3e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49818  predicted protein  45.48 
 
 		 525 aa  329  6e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  37.96 
 
 		 461 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  42.76 
 
 		 454 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 461 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  39.01 
 
 		 460 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  37.89 
 
 		 463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  38.92 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  39.22 
 
 		 462 aa  318  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  38.92 
 
 		 458 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  40.87 
 
 		 455 aa  317  4e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 		 458 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  38.96 
 
 		 458 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  38.71 
 
 		 458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  35.78 
 
 		 461 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  38.71 
 
 		 458 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  38.71 
 
 		 458 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  38.71 
 
 		 458 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  38.71 
 
 		 458 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  38.71 
 
 		 458 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  38.71 
 
 		 458 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  40.6 
 
 		 458 aa  312  9e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  40.6 
 
 		 458 aa  312  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  37.88 
 
 		 458 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  35.21 
 
 		 459 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  42.58 
 
 		 462 aa  306  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  41.13 
 
 		 462 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  43.19 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 		 447 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  38.74 
 
 		 455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  36.66 
 
 		 459 aa  299  6e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  37.09 
 
 		 460 aa  299  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  38.07 
 
 		 456 aa  299  7e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  43.38 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  40.74 
 
 		 461 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  39.96 
 
 		 459 aa  294  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  36.98 
 
 		 458 aa  293  3e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 457 aa  293  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  42.76 
 
 		 455 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  39.4 
 
 		 455 aa  292  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  38.21 
 
 		 450 aa  289  8e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  41.53 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  38.74 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  38.61 
 
 		 455 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  37.86 
 
 		 462 aa  286  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  41.33 
 
 		 446 aa  286  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  33.69 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  41.38 
 
 		 458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  43.04 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  36.58 
 
 		 459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  36.58 
 
 		 459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  42.26 
 
 		 455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  42.21 
 
 		 461 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  38.83 
 
 		 454 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  38.31 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  37.55 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  34.92 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  37.61 
 
 		 469 aa  279  6e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  41.63 
 
 		 456 aa  279  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  41.85 
 
 		 456 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  41.28 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  41.14 
 
 		 456 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  38.36 
 
 		 459 aa  277  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  36.74 
 
 		 460 aa  276  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  35.42 
 
 		 459 aa  276  8e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 448 aa  275  9e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  41.04 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  41.04 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  38.1 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 		 454 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0314  tRNA modification GTPase TrmE  41.15 
 
 		 450 aa  274  3e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00576337  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  38.12 
 
 		 444 aa  273  6e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  40.95 
 
 		 455 aa  273  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  34.93 
 
 		 441 aa  273  6e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  39.17 
 
 		 454 aa  273  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  44.16 
 
 		 452 aa  273  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  38.17 
 
 		 455 aa  272  1e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  38.51 
 
 		 475 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  40.6 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1965  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 468 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>