More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0314 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0314  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 450 aa  899    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00576337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  37.45 
 
 		 458 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  37.45 
 
 		 458 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  37.69 
 
 		 458 aa  296  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  35.14 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 		 461 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  34.41 
 
 		 459 aa  286  8e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  38.44 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  37.42 
 
 		 455 aa  273  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  35.59 
 
 		 462 aa  272  7e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0680  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 438 aa  272  9e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000180906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  35.14 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  35.23 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  35.21 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  34.71 
 
 		 459 aa  269  7e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  36.99 
 
 		 462 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  42.54 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  38.71 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  34.84 
 
 		 464 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  35.65 
 
 		 455 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  35.42 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  34.9 
 
 		 464 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  36.12 
 
 		 450 aa  264  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  35.93 
 
 		 455 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  36.48 
 
 		 455 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  40.72 
 
 		 451 aa  264  3e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  34.79 
 
 		 458 aa  264  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  32.39 
 
 		 461 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  38.65 
 
 		 465 aa  263  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  35.15 
 
 		 458 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  35.15 
 
 		 458 aa  263  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  35.15 
 
 		 458 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  35.15 
 
 		 458 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  35.15 
 
 		 458 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 		 458 aa  263  6e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  34.93 
 
 		 458 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  34.72 
 
 		 458 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  38.59 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  34.72 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1965  tRNA modification GTPase TrmE  37.26 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  35.76 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  34.93 
 
 		 455 aa  260  4e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  35.09 
 
 		 456 aa  260  4e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  39.1 
 
 		 471 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  34.72 
 
 		 458 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  36.09 
 
 		 456 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  40.85 
 
 		 437 aa  259  7e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  33.84 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  33.84 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  39.73 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  35.89 
 
 		 455 aa  257  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2084  tRNA modification GTPase TrmE  36.32 
 
 		 457 aa  256  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103263  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1783  tRNA modification GTPase TrmE  35.43 
 
 		 454 aa  256  7e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.028326  normal  0.377376 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 450 aa  256  8e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 457 aa  254  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  37.99 
 
 		 457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  36.91 
 
 		 473 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  34.73 
 
 		 459 aa  253  6e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  32.46 
 
 		 452 aa  252  8.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 478 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  35.98 
 
 		 454 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  34.78 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  40.82 
 
 		 456 aa  250  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  35.29 
 
 		 458 aa  249  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  34.78 
 
 		 473 aa  249  6e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  35.16 
 
 		 455 aa  249  7e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  33.62 
 
 		 455 aa  249  9e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  35.68 
 
 		 473 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  35.95 
 
 		 458 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  35.78 
 
 		 473 aa  246  4e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  32.46 
 
 		 452 aa  246  4e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 461 aa  246  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  34.92 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  35.71 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  35.75 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27541  tRNA modification GTPase TrmE  41.23 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  34.13 
 
 		 455 aa  243  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 449 aa  243  7e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  33.77 
 
 		 461 aa  242  9e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  36.15 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  31.48 
 
 		 461 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  32.68 
 
 		 447 aa  240  4e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  37.23 
 
 		 462 aa  240  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0018  tRNA modification GTPase TrmE  31.19 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  35.32 
 
 		 448 aa  239  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  36.93 
 
 		 473 aa  239  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  33.76 
 
 		 466 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 		 475 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  35.93 
 
 		 460 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  35.89 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  35.11 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  35.79 
 
 		 460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  34.57 
 
 		 456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  33.98 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  32.97 
 
 		 459 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  30.3 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>