More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0018 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0018  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 
438 aa  871    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  41.16 
 
 
452 aa  333  4e-90  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  41.16 
 
 
452 aa  322  9.000000000000001e-87  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  36.92 
 
 
458 aa  306  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  36.78 
 
 
458 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 
458 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 
458 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 
458 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 
458 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 
458 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 
458 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 
458 aa  300  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 
458 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  35.15 
 
 
461 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 
458 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf755  tRNA modification GTPase TrmE  39.28 
 
 
442 aa  297  2e-79  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  38.11 
 
 
450 aa  293  5e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  38.77 
 
 
450 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  37.89 
 
 
458 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  34.95 
 
 
462 aa  290  4e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  37.89 
 
 
458 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  36.47 
 
 
455 aa  289  5.0000000000000004e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  37.64 
 
 
460 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  34.51 
 
 
459 aa  279  7e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  36.5 
 
 
456 aa  279  8e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  34.5 
 
 
462 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 
459 aa  277  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  34.35 
 
 
459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  34.35 
 
 
459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  35.32 
 
 
458 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  35.59 
 
 
461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  36.11 
 
 
459 aa  270  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  33.92 
 
 
460 aa  266  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  34.44 
 
 
461 aa  263  4e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  39.47 
 
 
459 aa  262  6.999999999999999e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 
452 aa  258  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  31.53 
 
 
462 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  35.79 
 
 
441 aa  258  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  33.19 
 
 
458 aa  253  7e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 
458 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  32.9 
 
 
463 aa  252  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  36.28 
 
 
455 aa  251  1e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  34.15 
 
 
452 aa  252  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  33.77 
 
 
458 aa  250  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  33.92 
 
 
460 aa  250  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  36.84 
 
 
456 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  38.9 
 
 
447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  32.6 
 
 
456 aa  243  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  36.68 
 
 
446 aa  243  6e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  31 
 
 
454 aa  242  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  32.11 
 
 
464 aa  242  9e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  35.21 
 
 
461 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  35.58 
 
 
469 aa  242  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  31.73 
 
 
463 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0314  tRNA modification GTPase TrmE  31.19 
 
 
450 aa  239  5e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00576337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  31.79 
 
 
460 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  34.57 
 
 
455 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  31.79 
 
 
460 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  31.35 
 
 
458 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  32.6 
 
 
459 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  35.56 
 
 
455 aa  236  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  33.63 
 
 
446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  32.97 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  33.19 
 
 
461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  33.86 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  30.97 
 
 
475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  29.98 
 
 
462 aa  233  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  32.28 
 
 
461 aa  232  9e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  32.46 
 
 
459 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  31.51 
 
 
455 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2180  tRNA modification GTPase TrmE  35.33 
 
 
472 aa  231  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  32.82 
 
 
461 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  31.98 
 
 
444 aa  230  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  31.07 
 
 
437 aa  229  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 
448 aa  229  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  35.74 
 
 
466 aa  229  9e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  30.86 
 
 
446 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  30.2 
 
 
456 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  31 
 
 
456 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  32.02 
 
 
461 aa  227  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  32.44 
 
 
455 aa  226  6e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  32.68 
 
 
453 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  32.31 
 
 
458 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  31.95 
 
 
464 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  31.3 
 
 
462 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  30.92 
 
 
460 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  30.57 
 
 
456 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  30.57 
 
 
456 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3612  tRNA modification GTPase TrmE  31.81 
 
 
455 aa  223  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002017  GTPase and tRNA-U34 5-formylation enzyme TrmE  32.24 
 
 
453 aa  223  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0189213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  30.48 
 
 
455 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  32.62 
 
 
518 aa  223  7e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  34.9 
 
 
460 aa  223  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  31.91 
 
 
434 aa  223  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  31.71 
 
 
455 aa  223  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  34.73 
 
 
460 aa  222  8e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  32.77 
 
 
464 aa  222  8e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1859  tRNA modification GTPase TrmE  31.29 
 
 
444 aa  222  9e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  32.39 
 
 
457 aa  222  9e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  30.15 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>