More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0117 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 455 aa  900    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  42.58 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  39.18 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 462 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 		 461 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  37.26 
 
 		 461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  37.1 
 
 		 458 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  39.61 
 
 		 455 aa  296  5e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  38.16 
 
 		 456 aa  296  8e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  38.28 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  37.12 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  37.91 
 
 		 458 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  38.49 
 
 		 461 aa  294  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  37.91 
 
 		 458 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  36.3 
 
 		 454 aa  293  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  39.27 
 
 		 450 aa  292  7e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  36.91 
 
 		 458 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  38.86 
 
 		 455 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  37.12 
 
 		 460 aa  290  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 458 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 458 aa  289  9e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 458 aa  289  9e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 458 aa  289  9e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 458 aa  289  9e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 458 aa  289  9e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  37.55 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  37.01 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 452 aa  288  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  36.48 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  38.63 
 
 		 450 aa  286  5e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  36.07 
 
 		 460 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  36.07 
 
 		 460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  36.42 
 
 		 459 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  37.26 
 
 		 462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 		 447 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  34.69 
 
 		 461 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  36.77 
 
 		 455 aa  282  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  34.76 
 
 		 464 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  38.06 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  37.1 
 
 		 459 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  33.89 
 
 		 462 aa  279  9e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  36.27 
 
 		 455 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  35.79 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  36.99 
 
 		 458 aa  276  4e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  35.59 
 
 		 437 aa  276  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  37.25 
 
 		 455 aa  277  4e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  36.85 
 
 		 461 aa  276  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  35.56 
 
 		 473 aa  276  5e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  36.27 
 
 		 469 aa  276  5e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  36.34 
 
 		 459 aa  276  6e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  37.1 
 
 		 472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  35.43 
 
 		 458 aa  274  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  36.67 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  34.33 
 
 		 473 aa  273  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  35.36 
 
 		 461 aa  272  1e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  35.59 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  34.93 
 
 		 444 aa  270  4e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  34.92 
 
 		 463 aa  270  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 		 441 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  35.48 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  36.19 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  35.13 
 
 		 459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  35.13 
 
 		 459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  35.61 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  33.55 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  35.27 
 
 		 456 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  36.68 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  37.23 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  35.47 
 
 		 475 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  33.84 
 
 		 476 aa  263  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  37.12 
 
 		 461 aa  263  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  34.83 
 
 		 460 aa  261  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  35.34 
 
 		 462 aa  260  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  35.19 
 
 		 475 aa  260  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 467 aa  259  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  36.11 
 
 		 446 aa  259  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  35.93 
 
 		 457 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  36.38 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  35.35 
 
 		 450 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  36.31 
 
 		 518 aa  256  4e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 459 aa  256  4e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 468 aa  256  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  35.39 
 
 		 456 aa  256  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0314  tRNA modification GTPase TrmE  33.98 
 
 		 450 aa  256  8e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00576337  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2779  tRNA modification GTPase TrmE  33.55 
 
 		 473 aa  256  9e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  35.74 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  34.27 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  34.57 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0884  tRNA modification GTPase TrmE  34.4 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  34.98 
 
 		 455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  34.55 
 
 		 465 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  34.51 
 
 		 462 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  37.72 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  35.28 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  33.76 
 
 		 458 aa  250  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  33.69 
 
 		 462 aa  248  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  34.85 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>