More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1582 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  71.55 
 
 		 460 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  71.33 
 
 		 460 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  70.33 
 
 		 463 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 462 aa  913    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  68.4 
 
 		 458 aa  638    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  69.01 
 
 		 464 aa  633  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  70.68 
 
 		 460 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  66.74 
 
 		 467 aa  612  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  44.64 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  49.34 
 
 		 455 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  44.21 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49818  predicted protein  49.23 
 
 		 525 aa  412  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  51.52 
 
 		 450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  49.44 
 
 		 451 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  43.38 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27541  tRNA modification GTPase TrmE  49.78 
 
 		 465 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  40.34 
 
 		 463 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  41.81 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  43.6 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  43.26 
 
 		 461 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  41.25 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  41.25 
 
 		 460 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  42.14 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  40.61 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  41.45 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  41.92 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  41.48 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  41.65 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  41.45 
 
 		 458 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  41.92 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  41.92 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  41.92 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  41.92 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  41.92 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  43.99 
 
 		 462 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  42.37 
 
 		 462 aa  362  5.0000000000000005e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  45.34 
 
 		 461 aa  359  7e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  41.79 
 
 		 461 aa  354  2e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  35.51 
 
 		 461 aa  352  8.999999999999999e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  38.41 
 
 		 459 aa  348  9e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  39.22 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  35.87 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  43.89 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  36.1 
 
 		 460 aa  347  4e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  44.25 
 
 		 461 aa  345  8e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  44.2 
 
 		 454 aa  344  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  42.58 
 
 		 455 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 458 aa  342  7e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  36.32 
 
 		 460 aa  342  9e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  43.23 
 
 		 455 aa  340  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  44.59 
 
 		 460 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  41.9 
 
 		 458 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  41.9 
 
 		 458 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  38.41 
 
 		 459 aa  338  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  38.41 
 
 		 459 aa  338  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  39.22 
 
 		 447 aa  335  7.999999999999999e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  41.7 
 
 		 455 aa  335  9e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  43.38 
 
 		 462 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  39.65 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  40.47 
 
 		 459 aa  327  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  41.04 
 
 		 456 aa  326  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  42.42 
 
 		 459 aa  324  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  43.17 
 
 		 465 aa  320  5e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  46.12 
 
 		 452 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  43.41 
 
 		 456 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  37.8 
 
 		 455 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  37.01 
 
 		 459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 455 aa  312  6.999999999999999e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  36.82 
 
 		 452 aa  312  9e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  40.87 
 
 		 457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  43.23 
 
 		 471 aa  310  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  42.61 
 
 		 464 aa  309  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 		 450 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  38.51 
 
 		 458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 		 454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  37.45 
 
 		 461 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 		 450 aa  300  5e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 466 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 475 aa  295  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 470 aa  295  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  36.31 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  34.79 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  36.83 
 
 		 456 aa  289  6e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  33.55 
 
 		 452 aa  289  8e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  39.14 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  36.24 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  39.39 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 		 452 aa  285  9e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  41.24 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 452 aa  282  7.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 473 aa  282  9e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  38.2 
 
 		 456 aa  281  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  40.69 
 
 		 457 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  41.52 
 
 		 448 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  40.39 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  38.59 
 
 		 456 aa  280  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  40.26 
 
 		 455 aa  280  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  40.22 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  39.78 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  41.2 
 
 		 456 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>